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PETSc
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS | |
|---|---|---|---|---|---|
| petsc-3.1-p5 | intel 11.1.069 | Infiniband | /softs/PETSc/petsc-3.1-p5/intel/11.1.069/seq/bin | Centos 5 | |
| petsc-3.1-p5 | gnu 4.2.1 | Infiniband | /softs/PETSc/petsc-3.1-p5/gnu/4.2.1/acml-4.2.0/bin | Centos 5 | |
| petsc-3.1-p5 | pgi 11.0 | Infiniband | /softs/PETSc/petsc-3.1-p5/pgi/11.0/seq/bin | Centos 5 | |
| petsc-3.3.p0 | openmpi-1.4.5/gnu-4.6.3 | Infiniband | /softs/PETSc/petsc-3.3.p0/gnu/4.6.3/openmpi-1.4.5/acml-5.1.0/bin | Centos 5 | |
| petsc-3.1-p5 | openmpi-1.4.1 / intel 11.1.069 | Infiniband | /softs/PETSc/petsc-3.1-p5/intel/11.1.069/openmpi-1.4.1/mkl/bin | Centos 5 | |
| petsc-3.1-p5 | openmpi-1.4.3 / pgi 11.0 | Infiniband | /softs/PETSc/petsc-3.1-p5/pgi/11.0/openmpi-1.4.3/bin | Centos 5 | |
Installations optimisées de PETSc
Version petsc-3.5.0 compilée avec compilateur gnu-4.7.2 sur les systèmes Debian
Environnement de travail
Il faut d'abord charger l'environnement correspondant (Debian + Intel + OpenMPI) sur l'un des serveurs de compilation Debian :
$ module use /applis/PSMN/Modules/ $ module load Base/psmn $ unsetenv PETSC_ARCH PETSC_DIR $ setenv PETSC_DIR $PWD $ module load openmpi/1.6.4-gnu-4.7.2
Download PETSc
...
Etape de "configuration"
$ ...
Etape de "build"
$ ... $ ...
Test de l'installation
On peut lancer un test rapide fourni dans CP2K directement sur le serveur de compilation :
$ $
Regarder par exemple le temps total (2.9 s pour le cas présent)