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Compilation et d'exécution d'un programme (C)
Langage C, code séquentiel
Le programme SommeVecVecSEQ.c effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C.
Compilation du programme
- Définition du l'environnement) :
source /usr/local/modeles/gnu-4.6.3
- Vérification de la version du compilateur
gcc --version gcc (GCC) 4.6.3
- Compilation
gcc -o SommeVecVecSEQ.c.exe SommeVecVecSEQ.c
Le fichier binaire (exécutable) SommeVecVecSEQ.c.exe a été généré.
Exécution sur le serveur de compilation :
./SommeVecVecSEQ.c.exe
⇒ Le résultat s'affiche a l'écran :
Les deux vecteurs : A = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 B = 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 Le vecteur somme : C = 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
Exécution sur les nœuds
Il y a un script de soumission (batch.csh), et un script d'exécution (batchrun.csh) (ou batch.sh et batchrun.sh, pour le shell bash).
C'est le script de soumission qui doit être lance et c'est lui qui appelle le script d'exécution.
batch.csh → batchrun.csh → binaire
./batch.csh
Your job 769504 ("batchrun.csh") has been submitted
qstat
job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
769504 0.00000 batchrun.csh cicaluga qw 06/12/2012 07:21:46
- La sortie de l'écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier
batchrun.csh.o769504, - La sortie erreur (erreur standard) est redirigée dans le fichier
batchrun.csh.e769504.
cat batchrun.csh.o769504 Les deux vecteurs : A = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 B = 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 Le vecteur somme : C = 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
Langage C, code parallèle
Le programme SommeVecVecPAR.c effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C. Chaque étape est effectuée sur 2 processus. Si le programme est exécuté sur plusieurs cœurs, seuls deux cœurs sont effectivement utilises.
Compilation du programme
- Définition du l'environnement
source /usr/local/modeles/openmpi-1.4.5-gnu-4.6.3
- Vérification
mpicc -showme gcc -I/softs/openmpi-1.4.5-gcc-4.6.3/include -pthread -L/softs/openmpi-1.4.5-gcc-4.6.3/lib -lmpi -lopen-rte -lopen-pal -lrdmacm -libverbs -ldl -lnsl -lutil -lm
- Compilation
mpicc -o SommeVecVecPAR.c.exe SommeVecVecPAR.c
Le fichier binaire (exécutable) SommeVecVecPAR.c.exe a été généré.
Exécution sur le serveur de compilation
mpirun -np 2 ./SommeVecVecPAR.c.exe
Le résultat s'affiche a l'écran :
LES DEUX VECTEURS : A = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 B = 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 LES DEUX VECTEURS LOCAUX : Je suis le proc 0 parmi 2 processus A local ( proc 0 ) = 1 2 3 4 5 B local ( proc 0 ) = 9 8 7 6 5 Je suis le proc 1 parmi 2 processus A local ( proc 1 ) = 6 7 8 9 10 B local ( proc 1 ) = 4 3 2 1 0 LE VECTEUR SOMME LOCAL : C local ( proc 1 ) = 10 10 10 10 10 C local ( proc 0 ) = 10 10 10 10 10 LE VECTEUR SOMME : C = 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10
Exécution sur les nœuds
Il y a un script de soumission (batch.csh) et un script d'exécution (batchrun.csh), pour shell tcsh (ou batch.sh et batchrun.sh, pour le shell bash).
C'est le script de soumission qui doit être lance et c'est lui qui appelle le script d'exécution.
batch → batchrun → binaire
./batch.csh
Your job 772030 ("batchrun.csh") has been submitted
qstat
job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
772030 0.00000 batchrun.csh cicaluga qw 06/18/2012 07:41:51 2
qstat
job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
772030 0.05000 batchrun.csh cicaluga r 06/18/2012 07:42:16 r410B_ib_test@r410lin57.ens-ly 2
- La sortie de l'écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier
batchrun.csh.o772030, - La sortie erreur (erreur standard) est redirigée dans le fichier
batchrun.csh.e772030.
cat batchrun.csh.o772030 /home/cicaluga/Support/FormationPSMN/SommeVecVecPar LES DEUX VECTEURS : A = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 B = 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 LES DEUX VECTEURS LOCAUX : Je suis le proc 0 parmi 2 processus A local ( proc 0 ) = 1 2 3 4 5 B local ( proc 0 ) = 9 8 7 6 5 LE VECTEUR SOMME LOCAL : C local ( proc 0 ) = 10 10 10 10 10 LE VECTEUR SOMME : C = 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 Je suis le proc 1 parmi 2 processus A local ( proc 1 ) = 6 7 8 9 10 B local ( proc 1 ) = 4 3 2 1 0 C local ( proc 1 ) = 10 10 10 10 10