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documentation:tutorials:build:fortran_parallele [2018/01/17 10:41]
cicaluga
documentation:tutorials:build:fortran_parallele [2019/12/09 16:00] (Version actuelle)
ltaulell
Ligne 1: Ligne 1:
-====== Compilation et d'exécution d'un programme (Fortran) ======+====== Compilation et exécution d'un programme (Fortran ​90) ======
  
-{{INLINETOC}} + 
-===== Langage Fortran 90, code parallèle =====+===== Langage Fortran 90, code parallèle ​(MPI) =====
  
 Le programme [[documentation:​examples:​sommevecvecpar.f90|SommeVecVecPAR.f90]] effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C. Chaque étape est effectuée sur 2 processus. Si le programme est exécuté sur plusieurs cœurs, seuls deux cœurs seront réellement utilisés. Le programme [[documentation:​examples:​sommevecvecpar.f90|SommeVecVecPAR.f90]] effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C. Chaque étape est effectuée sur 2 processus. Si le programme est exécuté sur plusieurs cœurs, seuls deux cœurs seront réellement utilisés.
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 === Définition de l'​environnement : === === Définition de l'​environnement : ===
    
- +  ​* définition de l'​environnement ​
-  ​* définition de l'​environnement ​**pour tcsh**  +
-<code bash> +
-module load intel/​2017.4/​OpenMPI/​3.0.0  +
-</​code>​ +
- +
-  * définition de l'​environnement **pour bash** ​+
 <code bash> <code bash>
-module load intel/2017.4/​OpenMPI/​3.0.0 ​+module avail 
 +module load GCC/7.2.0/​OpenMPI/​3.0.0 ​
 </​code>​ </​code>​
  
Ligne 24: Ligne 19:
   * Vérification   * Vérification
 <​code>​ <​code>​
-mpif90 ​-showme+mpifort ​-showme
  
-ifort  ......+gfortran ​.....
 </​code>​ </​code>​
  
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 <​code>​ <​code>​
-mpif90 ​-o SommeVecVecPAR.f90.exe SommeVecVecPAR.f90 ​(avec intel)+mpifort ​-o SommeVecVecPAR.exe SommeVecVecPAR.f90 ​
 </​code>​ </​code>​
  
  
-Le fichier binaire (exécutable) ''​SommeVecVecPAR.f90.exe''​ est généré.+Le fichier binaire (exécutable) ''​SommeVecVecPAR.exe''​ est généré.
  
 ====Exécution du programme :==== ====Exécution du programme :====
Ligne 44: Ligne 39:
  
 <​code>​ <​code>​
-mpirun -np 2 ./​SommeVecVecPAR.f90.exe+mpirun -np 2 ./​SommeVecVecPAR.exe
 </​code>​ </​code>​
  
Ligne 71: Ligne 66:
  
  
-On utilise un script de soumission [[documentation:​tutorials:​submit&#​job_parallele_shell_bash)|batch.sh]] pour le shell bash (ou [[documentation:​tutorials:​submit:​jobparalleleshellcsh|batch.csh]] ) pour soumettre le job sur les clusters de calcul.+On utilise un script de soumission [[documentation:​tutorials:​submit:accueil&#​job_parallele_shell_bash)|batch.sh]] pour le shell bash (ou [[documentation:​tutorials:​submit:​jobparalleleshellcsh|batch.csh]] ) pour soumettre le job sur les clusters de calcul.
  
  
 C'est le script de soumission qui configure l'​environnement puis appelle votre binaire (avec ses options, s'il en a) sur les noeuds d'​execution. C'est le script de soumission qui configure l'​environnement puis appelle votre binaire (avec ses options, s'il en a) sur les noeuds d'​execution.
  
-''​SGE -> batch.csh -> binaire''​+''​SGE -> batch.sh -> binaire''​
  
 <​code>​ <​code>​
-qsub batch.csh +qsub batch.sh 
-Your job 772030 ​("​SommeVecVecPAR"​) has been submitted+Your job 336000 ​("​SommeVecVecPAR"​) has been submitted
 </​code>​ </​code>​
  
Ligne 88: Ligne 83:
 job-ID ​ prior   ​name ​            ​user ​        state submit/​start at     ​queue ​                         slots ja-task-ID ​ job-ID ​ prior   ​name ​            ​user ​        state submit/​start at     ​queue ​                         slots ja-task-ID ​
 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
- ​772030 ​0.00000 SommeVecVecPAR ​  ​Login ​    ​qw ​   ​06/18/2012 07:41:51                                    2        ​+336000 ​0.00000 SommeVecVecPAR ​  ​Login ​    ​qw ​   ​02/14/2018 10:53:51                                    2        ​
  
 qstat qstat
Ligne 94: Ligne 89:
 job-ID ​ prior   ​name ​            ​user ​        state submit/​start at     ​queue ​                         slots ja-task-ID ​ job-ID ​ prior   ​name ​            ​user ​        state submit/​start at     ​queue ​                         slots ja-task-ID ​
 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
- ​772030 ​0.05000 SommeVecVecPAR ​  ​Login ​    ​r ​    06/18/2012 07:42:16 r410B_ib_test@r410lin57.ens-ly ​    ​2 ​+336000 ​0.05000 SommeVecVecPAR ​  ​Login ​    ​r ​    02/14/2018 10:54:16 r410B_ib_test@r410lin57.ens-ly ​    ​2 ​
 </​code>​ </​code>​
  
-La sortie de l'​écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier ''​SommeVecVecPAR.o772030''​ et la sortie erreur est redirigée dans le fichier ''​SommeVecVecPAR.e772030''​.+La sortie de l'​écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier ''​SommeVecVecPAR.o336000''​ et la sortie erreur est redirigée dans le fichier ''​SommeVecVecPAR.e336000''​.
  
 <​code>​ <​code>​
-cat SommeVecVecPAR.o772030+cat SommeVecVecPAR.o336000
  
-/home/cicaluga/​Support/​FormationPSMN/​SommeVecVecPar+/home/ccalugar/​Support/​FormationPSMN/​SommeVecVecPar
  LES DEUX VECTEURS :  LES DEUX VECTEURS :
  A =            1           ​2 ​          ​3 ​          ​4 ​          ​5 ​          ​6 ​          ​7 ​          ​8 ​          ​9 ​         10  A =            1           ​2 ​          ​3 ​          ​4 ​          ​5 ​          ​6 ​          ​7 ​          ​8 ​          ​9 ​         10
documentation/tutorials/build/fortran_parallele.1516182096.txt.gz · Dernière modification: 2018/01/17 10:41 par cicaluga