Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
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documentation:tutorials:build:fortran_parallele [2018/01/17 19:24] cicaluga |
documentation:tutorials:build:fortran_parallele [2019/12/09 16:00] (Version actuelle) ltaulell |
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| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | ====== Compilation et d'exécution d'un programme (Fortran) ====== | + | ====== Compilation et exécution d'un programme (Fortran 90) ====== |
| - | {{INLINETOC}} | + | |
| - | ===== Langage Fortran 90, code parallèle ===== | + | ===== Langage Fortran 90, code parallèle (MPI) ===== |
| Le programme [[documentation:examples:sommevecvecpar.f90|SommeVecVecPAR.f90]] effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C. Chaque étape est effectuée sur 2 processus. Si le programme est exécuté sur plusieurs cœurs, seuls deux cœurs seront réellement utilisés. | Le programme [[documentation:examples:sommevecvecpar.f90|SommeVecVecPAR.f90]] effectue la somme des deux vecteurs A et B. Le résultat est mis dans C. Chaque étape est effectuée sur 2 processus. Si le programme est exécuté sur plusieurs cœurs, seuls deux cœurs seront réellement utilisés. | ||
| Ligne 10: | Ligne 10: | ||
| === Définition de l'environnement : === | === Définition de l'environnement : === | ||
| - | + | * définition de l'environnement | |
| - | * définition de l'environnement **pour tcsh** | + | |
| - | <code bash> | + | |
| - | module load iccifort/2017.4 | + | |
| - | module load intel/2017.4/OpenMPI/3.0.0 | + | |
| - | </code> | + | |
| - | + | ||
| - | * définition de l'environnement **pour bash** | + | |
| <code bash> | <code bash> | ||
| - | module load iccifort/2017.4 | + | module avail |
| - | module load intel/2017.4/OpenMPI/3.0.0 | + | module load GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0 |
| </code> | </code> | ||
| Ligne 28: | Ligne 21: | ||
| mpifort -showme | mpifort -showme | ||
| - | ifort ...... | + | gfortran ..... |
| </code> | </code> | ||
| Ligne 35: | Ligne 28: | ||
| <code> | <code> | ||
| - | mpifort -o SommeVecVecPAR.exe SommeVecVecPAR.f90 (avec intel) | + | mpifort -o SommeVecVecPAR.exe SommeVecVecPAR.f90 |
| </code> | </code> | ||
| - | Le fichier binaire (exécutable) ''SommeVecVecPAR.f90.exe'' est généré. | + | Le fichier binaire (exécutable) ''SommeVecVecPAR.exe'' est généré. |
| ====Exécution du programme :==== | ====Exécution du programme :==== | ||
| Ligne 73: | Ligne 66: | ||
| - | On utilise un script de soumission [[documentation:tutorials:submit&#job_parallele_shell_bash)|batch.sh]] pour le shell bash (ou [[documentation:tutorials:submit:jobparalleleshellcsh|batch.csh]] ) pour soumettre le job sur les clusters de calcul. | + | On utilise un script de soumission [[documentation:tutorials:submit:accueil&#job_parallele_shell_bash)|batch.sh]] pour le shell bash (ou [[documentation:tutorials:submit:jobparalleleshellcsh|batch.csh]] ) pour soumettre le job sur les clusters de calcul. |
| C'est le script de soumission qui configure l'environnement puis appelle votre binaire (avec ses options, s'il en a) sur les noeuds d'execution. | C'est le script de soumission qui configure l'environnement puis appelle votre binaire (avec ses options, s'il en a) sur les noeuds d'execution. | ||
| - | ''SGE -> batch.csh -> binaire'' | + | ''SGE -> batch.sh -> binaire'' |
| <code> | <code> | ||
| - | qsub batch.csh | + | qsub batch.sh |
| - | Your job 772030 ("SommeVecVecPAR") has been submitted | + | Your job 336000 ("SommeVecVecPAR") has been submitted |
| </code> | </code> | ||
| Ligne 90: | Ligne 83: | ||
| job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID | job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID | ||
| ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | ||
| - | 772030 0.00000 SommeVecVecPAR Login qw 06/18/2012 07:41:51 2 | + | 336000 0.00000 SommeVecVecPAR Login qw 02/14/2018 10:53:51 2 |
| qstat | qstat | ||
| Ligne 96: | Ligne 89: | ||
| job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID | job-ID prior name user state submit/start at queue slots ja-task-ID | ||
| ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | ||
| - | 772030 0.05000 SommeVecVecPAR Login r 06/18/2012 07:42:16 r410B_ib_test@r410lin57.ens-ly 2 | + | 336000 0.05000 SommeVecVecPAR Login r 02/14/2018 10:54:16 r410B_ib_test@r410lin57.ens-ly 2 |
| </code> | </code> | ||
| - | La sortie de l'écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier ''SommeVecVecPAR.o772030'' et la sortie erreur est redirigée dans le fichier ''SommeVecVecPAR.e772030''. | + | La sortie de l'écran (sortie standard) est redirigée dans le fichier ''SommeVecVecPAR.o336000'' et la sortie erreur est redirigée dans le fichier ''SommeVecVecPAR.e336000''. |
| <code> | <code> | ||
| - | cat SommeVecVecPAR.o772030 | + | cat SommeVecVecPAR.o336000 |
| - | /home/cicaluga/Support/FormationPSMN/SommeVecVecPar | + | /home/ccalugar/Support/FormationPSMN/SommeVecVecPar |
| LES DEUX VECTEURS : | LES DEUX VECTEURS : | ||
| A = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 | A = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 | ||