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documentation:tutorials:submit:jobsequentielbash [2018/10/04 16:58] – [job séquentiel (shell bash)] cicalugadocumentation:tutorials:submit:jobsequentielbash [2021/01/14 15:55] (Version actuelle) – [job séquentiel (shell bash)] cicaluga
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-Le système de batch actuellement utilisé par le PSMN est Sun Grid Engine (SGE). Sa documentation se trouve [[documentation:tools:sge|à cette page]] ainsi que [[faq:sge|dans la F.A.Q.]].+Le système de batch actuellement utilisé par le PSMN est Sun Grid Engine (SGE). Sa documentation se trouve [[documentation:tools:sge|à cette page]] ainsi que [[faq:accueil|dans la F.A.Q.]].
  
  
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 ### configurer l'environnement (a changer) ### configurer l'environnement (a changer)
-module load GCC/7.2.0 +module load GCC/7.2.0
  
 ### execution du programme (a changer avec votre executable) ### execution du programme (a changer avec votre executable)
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 #$ -N SommeVecVecSEQ #$ -N SommeVecVecSEQ
 ### file d'attente (a changer) ### file d'attente (a changer)
-#$ -q E5-2670_test+#$ -q E5_test
 ### charger l'environnement utilisateur pour SGE ### charger l'environnement utilisateur pour SGE
 #$ -cwd #$ -cwd
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 module load GCC/7.2.0  module load GCC/7.2.0 
  
-### definition SCRATCHDIR +### definition SCRATCHDIR en fonction de la partition existent 
-SCRATCHDIR=/scratch/votre_login/${SGE_O_WORKDIR}+ 
 +if [[ -d "/scratch/Lake" ]] 
 +then 
 +    SCRATCHDIR="/scratch/Lake/${USER}/${JOB_ID}/" 
 +elif [[ -d "/scratch/E5N" ]] 
 +then 
 +    SCRATCHDIR="/scratch/E5N/${USER}/${JOB_ID}/"  
 +else 
 +    echo "Cannot create ${SCRATCHDIR} on /scratch, creating it in the current directory" 
 +    SCRATCHDIR="${SGE_O_WORKDIR}/scratch/" 
 +fi 
 + 
 +###SCRATCHDIR=/scratch/E5N/votre_login/Formations/Sequentiel 
 ### verif SCRATCHDIR ### verif SCRATCHDIR
 echo "SCRATCHDIR=${SCRATCHDIR}" echo "SCRATCHDIR=${SCRATCHDIR}"
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 ### execution du programme ### execution du programme
-######EXECDIR=/scratch/cicaluga/tempo 
 EXECDIR=${SCRATCHDIR} EXECDIR=${SCRATCHDIR}
 ${EXECDIR}/SommeVecVecSEQ.exe > output_scratch ${EXECDIR}/SommeVecVecSEQ.exe > output_scratch
documentation/tutorials/submit/jobsequentielbash.1538672326.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)