Ceci est une ancienne révision du document !
Erreurs à l'execution
cannot open shared object file
Le programme ne trouve pas certains fichiers ou bibliothèques
mpirun: error while loading shared libraries: libimf.so: cannot open shared object file: No such file or directory
orted: error while loading shared libraries: libirng.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Vérifiez votre environnement (~/.cshrc, modules, etc) de compilation et d'execution (ex: vasp.j) : Ils doivent correspondre.
mpirun process exited on signal 10
mpirun noticed that process rank 13 with PID 50067 on node c8220node202.ens-lyon.fr exited on signal 10 (User defined signal 1).
Signal 10 = Walltime atteint Le job a été lancé sur une file d'attente courte (E5-2670deb64h3 = 3 heures, E5-2670deb64d3 = 3 jours)
Error for job [...] execvp()
Votre job plante trés vite, avec ce message d'erreur :
Error for job $JOB_ID: [...] execvp(/sge_spool/node/job_scripts/$JOB_ID, [...] failed: No such file or directory
Vérifiez votre script de soumission, il contient probablement des caractères Windows.
- Diagnostique :
comp% file script.sub script.sub: C shell script, ASCII text executable, with CRLF line terminators
CRLF (Carriage Return, Line Feed) est un terminateur de ligne propre à Windows, il provoque des erreurs dans l'environnement du PSMN.
- Résolution :
comp% dos2unix script.sub converting script.sub to Unix format ...
- Vérification :
comp% file script.sub script.sub: C shell script, ASCII text executable