Systèmes biologiques

Nous étudions plusieurs phénomènes se produisant dans les biomolécules (ADN, protéines, etc.) en mettant un accent particulier sur :

• Dommages et réparation de l'ADN : Le groupe a développé une expertise dans l'étude des (photo)lésions de l'ADN, en particulier liées à l'oxydation et/ou l'ionisation, afin de comprendre leur induction et leurs conséquences structurales. Nos études actuelles portent principalement sur le nucléosome, qui assure la compaction de l'ADN par l'enroulement de la double hélice autour d'un coeur protéique. Les protéines (les histones) induisent des contraintes mécaniques et un environnement électrostatique spécifiques qui impactent la formation de dommages et leur réparations. Nos simulations permettent de mieux comprendre cet impact et d'expliquer à l'échelle moléculaire les observations expérimentales.
• Interaction de petits ligands avec les protéines ou les cibles thérapeutiques: nous avons développés des collaborations avec différents membres du laboratoire en proposant de modéliser les interactions entre leurs molécules d'intérêt biologiques (médicament, crystallophore, agent de contraste, etc) avec leur cibles (protéines, ADN). Ces modèles permettent de mieux caractériser les réseaux d'interactions faibles pouvant induire une spécificité ou expliquer le fonctionnement des molécules en milieu biologique. Ils permettent de compléter d'autres données structurales (RMN, données spectroscopiques, cristallographie).