Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

Les deux révisions précédentesRévision précédente
Prochaine révision
Révision précédente
documentation:tools:software:braker [2017/01/30 16:18] – [Usage on PSMN] ltaulelldocumentation:tools:software:braker [2025/03/12 14:17] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
Ligne 1: Ligne 1:
  
-====== Braker ====== 
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  1.9  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Braker/1.9/bin  |  Generic  | 
-| | **modulefile** : Braker/1.9  |||| 
- 
-Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
- 
-===== Usage on PSMN ===== 
- 
-Braker 1.9 need additionals PERL modules installable from CPAN (see [[documentation:tools:langages:perl5|Perl5]] for CPAN installation/configuration ): 
- 
-<code perl> 
-cpan 
-> install File::Spec::Functions 
-> install Hash::Merge 
-> install List::Util 
-> install Logger::Simple 
-> install Module::Load::Conditional 
-> install Sub::Uplevel 
-> install Parallel::ForkManager 
-> install Scalar::Util::Numeric 
-#> install YAML (core module) 
-#> install POSIX (core module) 
-</code> 
- 
-See also [[documentation:tools:software:augustus|Augustus]] for additional configuration of ''--AUGUSTUS_CONFIG_PATH'' variable. 
- 
-===== Site officiel ===== 
- 
-  * http://exon.gatech.edu/braker1.html 
documentation/tools/software/braker.1485793133.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)