Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

Les deux révisions précédentesRévision précédente
Prochaine révision
Révision précédente
documentation:tools:software:gatk [2017/03/31 12:35] – [GATK / Genome Analysis Toolkit] cpetitdocumentation:tools:software:gatk [2025/03/12 15:01] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
Ligne 1: Ligne 1:
-====== GATK / Genome Analysis Toolkit ====== 
  
-  *  the toolkit offers a wide variety of tools with a primary focus on variant discovery and genotyping. 
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  3.6  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/GATK/3.6/  |  N/A  | 
-| | **modulefile** : GATK/3.6  |||| 
-|  3.4-46  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/GATK/3.4-46/  |  N/A  | 
-| | **modulefile** : GATK/3.4-46  |||| 
- 
- 
-Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
- 
-Usage : 
-''$GATKHOME'' est une variable d'environnement exposée par le modulefile ''GATK/<version>''. 
- 
-<code bash> 
-java -jar $GATKHOME/GenomeAnalysisTK.jar --help 
-</code> 
- 
-{{INLINETOC}} 
- 
-===== Site officiel ===== 
- 
-  * https://www.broadinstitute.org/gatk/ 
documentation/tools/software/gatk.1490963714.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)