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documentation:tools:software:gubbins [2018/01/29 14:12] – [Gubbins] cpetitdocumentation:tools:software:gubbins [2025/03/12 15:02] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-====== Gubbins ====== 
  
-  * **G**enealogies **U**nbiased **B**y recom**B**inations **I**n **N**ucleotide **S**equences, phylogenetic analysis of large samples of recombinant bacterial whole genome sequences.  
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  2.2.0  |  gcc 6.3.0  |  N/A  |  /usr/bin  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : N/A  |||| 
- 
- 
-Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
- 
-{{INLINETOC}} 
- 
-===== Site officiel ===== 
- 
-  * https://github.com/sanger-pathogens/gubbins/ 
-  * http://sanger-pathogens.github.io/gubbins/ 
- 
-Gubbins is an algorithm that iteratively identifies loci containing elevated densities of base substitutions while concurrently constructing a phylogeny based on the putative point mutations outside of these regions. 
documentation/tools/software/gubbins.1517235167.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)