Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente | ||
| documentation:tools:software:trimmomatic [2018/07/02 08:05] – [Trimmomatic] cpetit | documentation:tools:software:trimmomatic [2025/05/07 13:01] (Version actuelle) – supprimée ltaulell | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | ====== Trimmomatic ====== | ||
| - | |||
| - | * a multithreaded command line tool that can be used to trim and crop Illumina (fastaq) data as well as to remove adapters. | ||
| - | |||
| - | ^ Version | ||
| - | | 0.36 | N/A | N/A | / | ||
| - | | | **modulefile** : aucun |||| | ||
| - | |||
| - | <code bash> | ||
| - | # usage type | ||
| - | TRIMMOMATIC =/ | ||
| - | java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | <code bash> | ||
| - | ## Example | ||
| - | ## Quick start | ||
| - | # Paired End | ||
| - | java -jar <path to trimmomatic.jar> | ||
| - | </ | ||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | |||
| - | ===== Site officiel ===== | ||
| - | |||
| - | * http:// | ||