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Soutenance d’HDR de Cendrine Moskalenko

Molécules uniques et processus biologiques : étude de quelques systèmes hors d’équilibre

Vendredi 13 Février à 14h en salle des thèses

Résumé

Dans une première partie de l’exposé, j’évoquerai brièvement mes ‘débuts’ à l’interface physique-biologie lorsque, pendant mon post-doctorat, je me suis intéressée à l’étude des forces générées par les microtubules, qui sont des polymères du cytosquelette. En développant un système de micro-manipulation par pinces optiques, nous avons pu montrer que les propriétés de dynamique fortement hors d’équilibre des microtubules étaient essentielles pour le positionnement d’asters de microtubules en géométrie confinée. Ce système ‘mimait’ in-vitro le fuseau mitotique, structure responsable de la bonne ségrégation des chromosomes lors de la division cellulaire. Puis, l’essentiel de ma présentation sera consacré aux travaux plus récents effectués au Laboratoire Joliot-Curie, qui concernent la structure et de la dynamique de la chromatine. Nous avons utilisé une technique de visualisation de molécules uniques (la Microscopie à Force Atomique, AFM) pour étudier des mono- ou oligo-nucléosomes et quantifier leur structure et leur dynamique tant à l’équilibre que hors d’équilibre. En effet, l’organisation de l’ADN sous forme de nucléosome représente une barrière pour la liaison des facteurs de transcription à leur ADN-cible et interfère avec différents processus cellulaires tels que la transcription ou la réparation. Les facteurs de remodelage et l’incorporation de variant d’histones dans la chromatine sont utilisés à l’intérieur de la cellule pour surmonter cette barrière nucléosomale et modulent l’accès à l’ADN au travers du contrôle de la dynamique nucléosomale. En développant des outils d’analyse d’image systématique des images AFM obtenues, et en lien avec la modélisation physique de la dynamique des nucléosomes, nous nous sommes intéressés principalement à deux aspects : d’une part l’effet des variants d’histone (H2A.Bbd) sur la structure et la dynamique de mono-nucléosomes et de fibres de chromatine reconstituées et d’autre part les mécanismes de remodelage et de glissement de nucléosomes par les facteurs de remodelage (RSC, SWI/SNF).