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Soutenance d’HDR de Cédric Vaillant — Chapelet nucleosomal et organisation du génome
Soutenance d’HDR de Cédric Vaillant — Chapelet nucleosomal et organisation du génome
Vendredi 23 septembre 2011 à 11h Salle C023 (RDC LR6 côté Centre Blaise Pascal)
Résumé
Les propriétés de conformation de l’ADN jouent un rôle très important dans de nombreux processus nucléaires essentiels au bon fonctionnement de la cellule tels que la transcription et la réplication. L’organisation spatiale de la double hélice à toute échelle contrôle l’accessibilité des différents complexes protéiques à l’ADN et leur action. Ainsi dans les noyaux des cellules eucaryotes, l’ADN est localement organisé par des octamères de protéines (histones) en une structure qu’on appelle le nucléosome et qui correspond à un enroulement de 146 paires de bases autour de ce coeur protéique. L’arrangement linéaire de ces nucléosomes le long de la chaine ADN constitue le chapelet nucléosomal ou ``fibre de 11 nm’’. Au sein de cette fibre, le positionnement des nucléosomes apparaît comme un des facteurs déterminants des mécanismes de régulation de la transcription et de la réplication. En m’appuyant sur des travaux récents, je montrerai comment un simple modèle thermodynamique peut rendre compte du positionnement des nucléosomes observé in vivo dans différents génomes, de la levure a l’homme. Je montrerai aussi dans quelle mesure ce positionnement est-il induit (codé) par la séquence génomique : en d’autre terme, dans quelle mesure l’organisation du chapelet nucleosomal se reflète-il dans l’organisation du génome ?
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