Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
Prochaine révision | Révision précédente | ||
documentation:tools:software:canu [2017/01/20 11:31] – créée ltaulell | documentation:tools:software:canu [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 | ||
---|---|---|---|
Ligne 1: | Ligne 1: | ||
- | <note warning> | + | <note warning> |
- | ====== | + | ====== |
+ | |||
+ | * a fork of the [[documentation: | ||
^ Version | ^ Version | ||
- | | | + | | |
- | | | **modulefile** : Celera/WGS-8.3rc2 |||| | + | | | **modulefile** : Canu/1.4 |||| |
Pour utiliser les modulefiles, | Pour utiliser les modulefiles, | ||
- | <note important> | + | <note important> |
+ | |||
+ | * canu.defaults " | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | maxMemory = 250 | ||
+ | maxThreads = 16 | ||
+ | useGrid = remote | ||
+ | gridEngine = sge | ||
+ | gridEngineArrayMaxJobs = 7500 | ||
+ | gridEngineThreadsOption = -pe openmp16 THREADS | ||
+ | gridEngineMemoryOption = -l h_vmem=MEMORY | ||
+ | </code> | ||
- | {{INLINETOC}} | ||
==== Doc Admin-sys PSMN ==== | ==== Doc Admin-sys PSMN ==== | ||
- | | + | Canu est un fork de [[documentation: |
- | * http://wgs-assembler.sourceforge.net/wiki/index.php? | + | |
+ | | ||
+ | * http://canu.readthedocs.io/en/stable/index.html | ||
+ |