Lancer une session interactive GridEngine

  • sur un coeur :
qlogin -q r815_ib_test
  • sur 2 coeurs :
qlogin -q r815_ib_test -pe test 2

etc. (on sort de la session par “exit”)

Dans la session interactive multi-coeurs, pour exécuter un job (parallèle), il faudra utiliser :

mpirun -np 2 nom_executable

Il faut avoir, en préalable, configuré correctement son environnement, dans cette session interactive.

En effet, comme tout job GridEngine, le job interactif a aussi un identifiant (que l'on peut voir par “qstat” dans un autre terminal ssh sur un serveur de compilation). Et comme tout job GridEngine multi-coeur, il lui a été attribué une liste de machines (coeurs).

Cependant, des soucis peuvent apparaître (notamment sur l'utilisation du fichier qui indique cette liste de machines) et pour les éviter, je vous conseillerais d'envoyer plutôt en batch (pas en interactif), en regardant bien les fichiers de sortie de GridEngine (xxx.o, xxx.e).

faq/gridengine_interactive_session.txt · Dernière modification: 2020/08/25 17:58 (modification externe)