Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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documentation:tools:langages:python:modules [2020/05/26 09:22] ltaulelldocumentation:tools:langages:python:modules [2023/01/13 08:30] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-====== Modules python ====== 
- 
-===== Python 3.8.3 ===== 
-<code> python3.8 -m pip list | awk '{print "  * "$0}' </code> 
- 
-<WRAP col3> 
-  * alabaster             0.7.12 
-  * appdirs               1.4.4 
-  * attrs                 19.3.0 
-  * backcall              0.1.0 
-  * beniget               0.2.1 
-  * bigfloat              0.4.0 
-  * biopython             1.77 
-  * CacheControl          0.12.6 
-  * certifi               2020.4.5.1 
-  * cffi                  1.14.0 
-  * chardet               3.0.4 
-  * click                 7.1.2 
-  * coloredlogs           14.0 
-  * colormath             3.0.0 
-  * ConfigArgParse        1.2.3 
-  * cutadapt              2.10 
-  * cycler                0.10.0 
-  * Cython                0.29.19 
-  * datrie                0.8.2 
-  * decorator             4.4.2 
-  * DendroPy              4.4.0 
-  * dill                  0.3.1.1 
-  * dnaio                 0.4.2 
-  * docutils              0.16 
-  * drmaa                 0.7.9 
-  * entrypoints           0.3 
-  * ete3                  3.1.1 
-  * execo                 2.6.4 
-  * fabio                 0.10.2 
-  * freetype-py           2.1.0.post1 
-  * frozendict            1.2 
-  * future                0.18.2 
-  * gast                  0.3.3 
-  * gitdb                 4.0.5 
-  * GitPython             3.1.2 
-  * gnureadline           8.0.0 
-  * gprof2dot             2019.11.30 
-  * graphviz              0.14 
-  * h5py                  2.10.0 
-  * hdf5plugin            2.3.0 
-  * hdf5storage           0.1.15 
-  * hdmedians             0.13 
-  * HTSeq                 0.12.4 
-  * humanfriendly         8.2 
-  * idna                  2.9 
-  * intervaltree          3.0.2 
-  * invoke                1.4.1 
-  * ipykernel             5.3.0 
-  * ipython               7.14.0 
-  * ipython-genutils      0.2.0 
-  * jedi                  0.17.0 
-  * Jinja2                2.11.2 
-  * joblib                0.15.1 
-  * jsonschema            3.2.0 
-  * jupyter-client        6.1.3 
-  * jupyter-core          4.6.3 
-  * kiwisolver            1.2.0 
-  * lockfile              0.12.2 
-  * lxml                  4.5.1 
-  * lzstring              1.0.4 
-  * Mako                  1.1.2 
-  * Markdown              3.2.2 
-  * MarkupSafe            1.1.1 
-  * matplotlib            3.2.1 
-  * Mikado                1.2.4 
-  * more-itertools        8.3.0 
-  * mpmath                1.1.0 
-  * msgpack               1.0.0 
-  * multiprocess          0.70.9 
-  * multiqc               1.8 
-  * mysql-connector       2.2.9 
-  * natsort               7.0.1 
-  * nbformat              5.0.6 
-  * networkx              2.4 
-  * nose                  1.3.7 
-  * numpy                 1.18.4 
-  * packaging             20.4 
-  * pandas                1.0.3 
-  * parso                 0.7.0 
-  * pathos                0.2.5 
-  * patsy                 0.5.1 
-  * pexpect               4.8.0 
-  * pickleshare           0.7.5 
-  * Pillow                7.1.2 
-  * pip                   20.1.1 
-  * pkgconfig             1.5.1 
-  * pluggy                0.13.1 
-  * ply                   3.11 
-  * pox                   0.2.7 
-  * ppft                  1.6.6.1 
-  * prompt-toolkit        3.0.5 
-  * protobuf              3.12.1 
-  * psutil                5.7.0 
-  * ptyprocess            0.6.0 
-  * py                    1.8.1 
-  * pybedtools            0.8.1 
-  * pyBigWig              0.3.17 
-  * pycparser             2.20 
-  * pyfaidx               0.5.8 
-  * pyfasta               0.5.2 
-  * Pygments              2.6.1 
-  * PyOpenGL              3.1.5 
-  * pyparsing             2.4.7 
-  * PyQt5                 5.14.2 
-  * PyQt5-sip             12.7.2 
-  * pyrsistent            0.16.0 
-  * pysam                 0.15.4 
-  * pytest                5.4.2 
-  * python-dateutil       2.8.1 
-  * python-magic          0.4.18 
-  * python-pptx           0.6.18 
-  * pythran               0.9.5 
-  * pytz                  2020.1 
-  * PyVTK                 0.5.18 
-  * PyYAML                5.3.1 
-  * pyzmq                 19.0.1 
-  * qtconsole             4.7.4 
-  * QtPy                  1.9.0 
-  * ratelimiter           1.2.0.post0 
-  * requests              2.23.0 
-  * restructuredtext-lint 1.3.0 
-  * rpy2                  3.3.3 
-  * ruamel.yaml           0.16.10 
-  * ruamel.yaml.clib      0.2.0 
-  * scikit-bio            0.5.6 
-  * scikit-learn          0.23.1 
-  * scipy                 1.4.1 
-  * seaborn               0.10.1 
-  * setuptools            46.4.0 
-  * silx                  0.12.0 
-  * simplejson            3.17.0 
-  * six                   1.15.0 
-  * smmap                 3.0.4 
-  * snakemake             5.18.1 
-  * sortedcontainers      2.1.0 
-  * spectra               0.0.11 
-  * SQLAlchemy            1.3.17 
-  * SQLAlchemy-Utils      0.36.6 
-  * statsmodels           0.11.1 
-  * tabulate              0.8.7 
-  * threadpoolctl         2.0.0 
-  * toposort              1.5 
-  * tornado               6.0.4 
-  * traitlets             4.3.3 
-  * tzlocal               2.1 
-  * ujson                 2.0.3 
-  * urllib3               1.25.9 
-  * vext                  0.7.3 
-  * vext.wx               0.7.0 
-  * vispy                 0.6.4 
-  * wcwidth               0.1.9 
-  * wheel                 0.34.2 
-  * wrapt                 1.12.1 
-  * XlsxWriter            1.2.8 
-  * xopen                 0.8.4 
-  * zipfile2              0.0.12 
-</WRAP> 
- 
-===== Python 3.6.1 ===== 
-<code> python3.6 -m pip list | awk '{print "  * "$0}' </code> 
- 
-<WRAP col3> 
-  * altgraph                     0.16.1 
-  * appdirs                      1.4.3 
-  * args                         0.1.0 
-  * asn1crypto                   0.24.0 
-  * attrs                        17.4.0 
-  * auxlib                       0.0.42 
-  * backcall                     0.1.0 
-  * bam2x                        0.2.6 
-  * beniget                      0.2.1 
-  * bigfloat                     0.4.0 
-  * biopython                    1.70 
-  * bitarray                     0.8.1 
-  * bitstring                    3.1.5 
-  * bleach                       2.1.2 
-  * blist                        1.3.6 
-  * bx-python                    0.8.1 
-  * certifi                      2017.11.5 
-  * cffi                         1.11.2 
-  * chardet                      3.0.4 
-  * click                        6.7 
-  * clint                        0.5.1 
-  * coloredlogs                  14.0 
-  * colorlog                     3.1.2 
-  * colormath                    3.0.0 
-  * conda                        4.3.16 
-  * ConfigArgParse               0.14.0 
-  * cryptography                 2.1.4 
-  * cutadapt                     1.15 
-  * cycler                       0.10.0 
-  * Cython                       3.0a5 
-  * datrie                       0.7.1 
-  * deap                         1.0.2 
-  * decorator                    4.1.2 
-  * deepdiff                     3.3.0 
-  * DendroPy                     4.3.0 
-  * dill                         0.2.8.2 
-  * distribute                   0.7.3 
-  * docopt                       0.6.2 
-  * docutils                     0.16 
-  * drmaa                        0.7.9 
-  * ecdsa                        0.13 
-  * entrypoints                  0.2.3 
-  * enum34                       1.1.6 
-  * ete3                         3.1.1 
-  * execo                        2.6.3 
-  * fabio                        0.6.0 
-  * fastnumbers                  3.0.0 
-  * frozendict                   1.2 
-  * funcsigs                     1.0.2 
-  * future                       0.16.0 
-  * gast                         0.3.3 
-  * gitdb2                       2.0.5 
-  * GitPython                    2.1.11 
-  * gnureadline                  6.3.8 
-  * gprof2dot                    2017.9.19 
-  * hdf5plugin                   2.0.0b0 
-  * hdf5storage                  0.1.15 
-  * hmmlearn                     0.2.0 
-  * html5lib                     1.0.1 
-  * HTSeq                        0.11.2 
-  * humanfriendly                8.2 
-  * idna                         2.6 
-  * importlib                    1.0.4 
-  * intervaltree                 2.1.0 
-  * intervaltree-bio             1.0.1 
-  * invoke                       0.22.0 
-  * ipykernel                    4.7.0 
-  * ipython                      6.2.1 
-  * ipython-genutils             0.2.0 
-  * ipywidgets                   7.1.0 
-  * jedi                         0.11.1 
-  * Jinja2                       2.10 
-  * joblib                       0.11 
-  * jsonpickle                   1.0 
-  * jsonschema                   2.6.0 
-  * jupyter                      1.0.0 
-  * jupyter-client               5.2.1 
-  * jupyter-console              6.1.0 
-  * jupyter-core                 4.4.0 
-  * kiwisolver                   1.1.0 
-  * liac-arff                    2.1.0 
-  * llvmlite                     0.32.1 
-  * lxml                         4.2.5 
-  * lzstring                     1.0.3 
-  * macholib                     1.11 
-  * Mako                         1.0.7 
-  * Markdown                     2.6.11 
-  * MarkupSafe                   1.0 
-  * matplotlib                   3.2.1 
-  * Mikado                       2.0rc2 
-  * mistune                      0.8.3 
-  * mock                         2.0.0 
-  * mpi4py                       2.0.0 
-  * mpmath                       1.0.0 
-  * multiprocess                 0.70.6.1 
-  * multiqc                      1.8 
-  * mysql-connector              2.1.4 
-  * nbconvert                    5.3.1 
-  * nbformat                     4.4.0 
-  * netaddr                      0.7.19 
-  * netifaces                    0.10.5 
-  * networkx                     1.11 
-  * nose                         1.3.7 
-  * notebook                     5.3.0rc1 
-  * numba                        0.49.1 
-  * numexpr                      2.7.0 
-  * numpy                        1.19.0rc1 
-  * numpy-groupies               0+unknown 
-  * pandas                       0.22.0 
-  * pandocfilters                1.4.2 
-  * paramiko                     2.1.2 
-  * parso                        0.1.1 
-  * pathos                       0.2.2.1 
-  * paycheck                     1.0.2 
-  * pbr                          2.0.0 
-  * pefile                       2018.8.8 
-  * pexpect                      4.3.1 
-  * pickleshare                  0.7.4 
-  * Pillow                       5.0.0 
-  * pip                          20.2b1 
-  * pkgconfig                    1.5.1 
-  * pluggy                       0.6.0 
-  * ply                          3.11 
-  * pox                          0.2.4 
-  * ppft                         1.6.4.8 
-  * prompt-toolkit               2.0.9 
-  * protobuf                     3.5.1 
-  * ptyprocess                   0.5.2 
-  * pudb                         2017.1.4 
-  * py                           1.5.2 
-  * pyasn1                       0.4.2 
-  * pybedtools                   0.7.10 
-  * pycosat                      0.6.3 
-  * pycparser                    2.18 
-  * pycrypto                     2.6.1 
-  * pyDNase                      0.3.0 
-  * pyfaidx                      0.5.5.2 
-  * pyfasta                      0.5.2 
-  * Pygments                     2.2.0 
-  * PyInstaller                  3.4 
-  * pyopencl                     2018.1.1 
-  * PyOpenGL                     3.1.1a1 
-  * pyparsing                    2.2.0 
-  * PyQt5                        5.10.1 
-  * pysam                        0.13 
-  * pytest                       3.4.1 
-  * python-dateutil              2.6.0 
-  * python-lzo                   1.11 
-  * python-magic                 0.4.15 
-  * python-pptx                  0.6.16 
-  * pythran                      0.9.5 
-  * pytools                      2018.1 
-  * pytz                         2017.2 
-  * PyVTK                        0.5.18 
-  * PyYAML                       4.2b4 
-  * pyzmq                        17.0.0b3 
-  * qtconsole                    4.3.1 
-  * QtPy                         1.4.0 
-  * quast                        4.6.3 
-  * ratelimiter                  1.2.0.post0 
-  * requests                     2.23.0 
-  * restructuredtext-lint        1.3.0 
-  * rpy2                         3.0.1 
-  * rpy2-bioconductor-extensions 0.2.5.dev0 
-  * ruamel.yaml                  0.15.35 
-  * scikit-image                 0.13.1 
-  * scikit-learn                 0.19.1 
-  * scipy                        1.4.1 
-  * seaborn                      0.9.0 
-  * Send2Trash                   1.4.2 
-  * seqlearn                     0.2 
-  * setuptools                   28.8.0 
-  * silx                         0.7.0 
-  * simplegeneric                0.8.1 
-  * simplejson                   3.13.2 
-  * sip                          4.19.8 
-  * six                          1.11.0 
-  * smmap2                       2.0.5 
-  * snakemake                    5.4.1 
-  * sortedcontainers             1.5.9 
-  * spectra                      0.0.11 
-  * SQLAlchemy                   1.3.0b3 
-  * SQLAlchemy-Utils             0.33.11 
-  * sympy                        1.1.1 
-  * tables                       3.6.0 
-  * tabulate                     0.8.3 
-  * terminado                    0.8.1 
-  * testpath                     0.3.1 
-  * toml                         0.10.1 
-  * tomlkit                      0.6.0 
-  * tornado                      5.0a1 
-  * tqdm                         4.46.0 
-  * traitlets                    4.3.2 
-  * twobitreader                 3.1.6 
-  * ujson                        1.35 
-  * urllib3                      1.22 
-  * urwid                        1.3.1 
-  * vext                         0.7.0 
-  * vext.pyqt4                   0.5.20 
-  * vext.wx                      0.6.8 
-  * virtualenv                   15.1.0 
-  * vispy                        0.5.2 
-  * ViTables                     3.0.0 
-  * wcwidth                      0.1.7 
-  * webencodings                 0.5.1 
-  * wheel                        0.33.0 
-  * widgetsnbextension           3.1.0 
-  * wrapt                        1.11.1 
-  * XlsxWriter                   1.1.2 
-  * xopen                        0.3.2 
-  * zipfile2                     0.0.12 
-</WRAP> 
- 
- 
- 
- 
-===== Python 2.7.13 ===== 
- 
-<code>pip list --format=legacy | awk '{print "  * "$0}'</code> 
- 
-<WRAP col3> 
-  * altgraph (0.16.1) 
-  * appdirs (1.4.3) 
-  * args (0.1.0) 
-  * ase (3.15.0) 
-  * asn1crypto (0.23.0) 
-  * attrs (17.4.0) 
-  * backports.functools-lru-cache (1.4) 
-  * backports.shutil-get-terminal-size (1.0.0) 
-  * bam2x (0.2.6) 
-  * bigfloat (0.4.0) 
-  * biopython (1.70) 
-  * bitarray (0.8.1) 
-  * bitstring (3.1.5) 
-  * blist (1.3.6) 
-  * bx-python (0.8.1) 
-  * bz2file (0.98) 
-  * certifi (2017.11.5) 
-  * cffi (1.11.2) 
-  * chardet (3.0.4) 
-  * click (6.7) 
-  * clint (0.5.1) 
-  * clipper (0.2.0) 
-  * colormath (3.0.0) 
-  * conda (4.3.16) 
-  * configparser (3.5.0) 
-  * cryptography (2.1.3) 
-  * cutadapt (1.16) 
-  * cycler (0.10.0) 
-  * Cython (0.27.3) 
-  * deap (1.0.2) 
-  * decorator (4.1.2) 
-  * dis3 (0.1.3) 
-  * distribute (0.7.3) 
-  * docopt (0.6.2) 
-  * ecdsa (0.13) 
-  * enum34 (1.1.6) 
-  * ete2 (2.3.10) 
-  * ete3 (3.1.1) 
-  * Flask (0.12.2) 
-  * funcsigs (1.0.2) 
-  * future (0.16.0) 
-  * gprof2dot (2017.9.19) 
-  * GPy (1.9.2) 
-  * h5py (2.7.1) 
-  * hmmlearn (0.2.0) 
-  * HTSeq (0.9.1) 
-  * idna (2.6) 
-  * intervaltree (2.1.0) 
-  * intervaltree-bio (1.0.1) 
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-  * ipython (5.5.0) 
-  * ipython-genutils (0.2.0) 
-  * itsdangerous (0.24) 
-  * Jinja2 (2.10) 
-  * joblib (0.11) 
-  * liac-arff (2.1.0) 
-  * libtiff (0.4.2) 
-  * lxml (4.1.1) 
-  * lzstring (1.0.3) 
-  * macholib (1.11) 
-  * MACS2 (2.1.1.20160309) 
-  * Mako (1.0.7) 
-  * Markdown (2.6.9) 
-  * MarkupSafe (1.0) 
-  * matplotlib (1.5.3) 
-  * mock (2.0.0) 
-  * mpi4py (2.0.0) 
-  * mpmath (1.0.0) 
-  * multiqc (1.4) 
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-  * networkx (2.0) 
-  * nose (1.3.7) 
-  * numpy (1.14.0) 
-  * pandas (0.22.0) 
-  * paramiko (2.1.2) 
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-  * Pillow (5.0.0) 
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-  * ProfileNJ (20161018) 
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-  * python-dateutil (2.6.1) 
-  * python-lzo (1.11) 
-  * pytools (2018.1) 
-  * pytz (2017.3) 
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-  * QtPy (1.3.1) 
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-  * requests (2.18.4) 
-  * RiboCode (1.2.7) 
-  * RSeQC (2.6.4) 
-  * ruamel.ordereddict (0.4.13) 
-  * ruamel.yaml (0.15.35) 
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-  * scikit-image (0.13.1) 
-  * scikit-learn (0.19.1) 
-  * scipy (1.0.0) 
-  * seqlearn (0.2) 
-  * setuptools (39.0.1) 
-  * silx (0.7.0) 
-  * simplegeneric (0.8.1) 
-  * simplejson (3.12.0) 
-  * six (1.11.0) 
-  * sklearn (0.0) 
-  * sortedcontainers (1.5.7) 
-  * spectra (0.0.11) 
-  * subprocess32 (3.5.0rc1) 
-  * traitlets (4.3.2) 
-  * twobitreader (3.1.6) 
-  * urllib3 (1.22) 
-  * urwid (1.3.1) 
-  * vext (0.7.0) 
-  * vext.pyqt4 (0.5.20) 
-  * vext.pyqt5 (0.5.21) 
-  * vext.wx (0.6.8) 
-  * virtualenv (15.1.0) 
-  * wcwidth (0.1.7) 
-  * Werkzeug (0.14.1) 
-  * xopen (0.3.2) 
-  * zipfile2 (0.0.12) 
-</WRAP> 
- 
- 
  
documentation/tools/langages/python/modules.1590484959.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)