Agenda de l'ENS de Lyon

Il est communément admis que l’organisation de la chromatine a une importance fonctionnelle pour contrôler l’expression des gènes. Par contre, les liens qui l’unissent au déroulement de la réplication de l'ADN sont moins connus.
Grâce à des approches basées sur la capture d’interactions chromosomiques et sur l’imagerie cellulaire, nous avons étudié les liens entre le repliement à grande échelle de la chromatine et le timing de réplication. Cette étude, effectuée dans des cellules humaines lymphoblastoïdes, des lymphocytes et des cellules de leucémie myéloïde à propriétés érythrocytaires, montre que les zones d’initiation précoce interagissent préférentiellement ensemble, aussi bien entre voisins immédiats (séparation génomique de l’ordre du mégabase) que le long du chromosome entier. Des frontières physiques isolant des domaines fonctionnels de réplication ont également été observées au niveau des zones d’initiation précoces. Les régions répliquées tardivement interagissent elles-aussi avec leurs homologues, conduisant à une ségrégation des loci dans l’espace nucléaire en fonction de leur timing de réplication. Ces résultats sont largement soutenus par des mesures de distances par hybridation in-situ qui montrent que les loci répliqués en début de phase S sont plus proches qu’attendus.
Nos travaux révèlent également que l’organisation de la chromatine est similaire dans des cellules en G0 (lymphocytes dormants). Ce dernier résultat suggère que les robustes liens entre organisation de la chromatine à grande échelle et timing de réplication ne s’établissent pas simplement pendant la phase S et persistent vraisemblablement tout au long du cycle cellulaire.