C'est un centre à vocation interdisciplinaire qui entend favoriser les rencontres et les croisements entre chercheurs et créateurs, entre des chercheurs issus de domaines différents, de traditions et de cultures diverses, par des études sur auteurs ou des études généralistes.

« Comprendre les maladies infectieuses pour mieux les contrôler » : telle est la devise du Centre International de Recherche en Infectiologie, le CIRI !

Pluralisme théorique, méthodologique et épistémologique définisse le Centre Max Weber. 

Le CRAL est un laboratoire de recherche fondamentale en astrophysique et de développement d’instruments destinés aux grands observatoires.

Laboratoire unique en France par son positionnement chronologique, ses terrains de prédilection que sont le quart sud-est de la France et le monde méditerranéen , sa pratique de l’interdisciplinarité et du comparatisme entre les mondes chrétiens et musulmans, mais aussi à l'intérieur même de ces aires culturelles.

Le GATE Lyon-Saint-Etienne étudie les interactions et la coordination entre agents économiques : formation de réseaux, coopération entre agents, externalités.

L’Institut d’Asie Orientale (IAO) est un centre de recherche en sciences humaines et sociales qui associe des chercheurs spécialisés en anthropologie, droit, économie, géographie, histoire, littérature, philosophie et science politique dont les travaux portent principalement sur l’Asie de l’Est et du Sud-Est, en particulier la Chine, la Corée, le Japon, le Laos, Taiwan, la Thaïlande et le Vietnam.

L'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) développe un projet original et ambitieux: rassembler dans une unité de lieu des scientifiques de haut niveau provenant d'horizons très variés pour développer des recherches en génomique fonctionnelle.

L’IHRIM (Institut d’Histoire des Représentations et des Idées dans les Modernités) est une UMR transséculaire (XVIe-XXe siècles) et pluridisciplinaire (philosophie, littératures française et étrangères, musicologie, études théâtrales, histoire de l’art, histoire des sciences et des techniques).

Les réseaux sont au cœur des préoccupations actuelles de l'Institut Rhônalpin des Systèmes Complexes (IXXI), de la science des réseaux à l'impact de la révolution numérique sur l'économie ou l'organisation de la société.

L'Institut des Sciences Analytiques (ISA) contribue à l’innovation des sciences analytiques par le développement de nouvelles méthodes  en chimie analytique, biochimie, chimie-physique, chimie théorique, électrochimie…

Le laboratoire ICAR se caractérise par des activités scientifiques pluridisciplinaires focalisées sur l’analyse multidimensionnelle des usages de la langue dans l’interaction et dans le texte, appréhendée de manière outillée sur de grands corpus de données orales interactives et textuelles.

Le Laboratoire d’Anthropologie des Enjeux Contemporains (LADEC) est une formation de recherche en évolution (FRE 2002) consacrée à l’analyse anthropologique des phénomènes et des enjeux contemporains.

Le laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC) conduit une série de recherches destinée à clarifier les bases moléculaires du fonctionnement et de la programmation des cellules (division, prolifération, apoptose, sénescence, différenciation...).

Une large variété de thématiques en chimie et en physico-chimie est abordée dans le Laboratoire de Chimie. Celui-ci développe des projets de recherche interdisciplinaires à la frontière avec la biologie, les sciences des matériaux et la physique.