La couleur est un trait biologique essentiel et très variable qui permet à un organisme d’être adapté à son environnement biotique et abiotique. De multiples gènes influent sur la couleur ; leur évolution a été étudiée ici chez les Vertébrés en lien avec les duplications de génome survenues dans cette lignée. Alors que l'essentiel des gènes sont perdus lors de la rediploïdisation suivant une duplication totale de génome, ces travaux montrent que les gènes de la pigmentation appartiennent à des familles de gènes qui sont en moyenne plus retenues que le reste du génome.
Ceci est particulièrement vrai pour les poissons téléostéens, cette expansion du répertoire de gènes de pigmentation pouvant être en lien avec la grande diversité de cellules pigmentaires et de patrons de pigmentation observés chez ces animaux. Par ailleurs, l’étude de la pigmentation d’un organisme modèle émergent, le poisson-clown Amphiprion ocellaris, a été réalisée dans le cadre de cette thèse. La nature cellulaire de la bande blanche de ce poisson a été déterminée et a permis l’identification d’un nouveau gène présent presque exclusivement chez les poissons Actinoptérygiens et probablement impliqué dans le développement d’un type de cellules pigmentaires, les iridophores. Enfin, l’acquisition de la pigmentation au cours du développement du Poisson-clown A. ocellaris, qui est un poisson corallien au cycle de développement marqué par une métamorphose, a été étudiée en rapport avec la signalisation de la voie des hormones thyroïdiennes – une voie majeure du développement chez les Vertébrés.
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