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Spatial-Cell-ID : mise en ligne du site web

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Actualité

Résumé

EquipEx+ porté par l’ENS de Lyon, Spatial-Cell-ID propose un équipement national pour identifier et caractériser le transcriptome de chaque cellule, tout en conservant sa position spatiale, dans les organismes multicellulaires.

Description

Les mécanismes biologiques fondamentaux sont contrôlés par la régulation fine des réseaux génétiques dans le temps et l'espace au niveau de la cellule unique. Pour des raisons techniques, les biologistes se sont longtemps limités à observer le transcriptome moyen de groupes de cellules au sein d'un tissu ou d'un organe.

Les tissus sont cependant constitués de cellules individuelles à différents stades de développement, de formes et de fonctions variées. Ces différences se caractérisent par une hétérogénéité d'expression génétique entre cellules voisines. Il est devenu essentiel de caractériser systématiquement la distribution spatiale de cette hétérogénéité et sa dynamique au cours du temps in situ.

C’est ce que vise Spatial-Cell-ID : identifier et caractériser le transcriptome de chaque cellule et sa dynamique dans les organismes animaux et végétaux, qu'ils soient adultes ou en développement, sains ou malades.

L’équipement, en phase de développement jusqu’en 2024, intégrera les dernières avancées en matière de transcriptomique spatiale. L’éventail d'approches de pointe proposé, travaillant en synergie sur un même site, est sans précédent en Europe. Spatial-Cell-ID est la première installation en France à fournir une analyse spatio-temporelle intégrée de la cellule unique, en relation étroite avec le réseau national d'infrastructures de génomique "France Génomique", d'imagerie "France BioImaging" et de bioinformatique "Institut Français de Bioinformatique".

Site web Spatial-Cell-ID

 

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