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Biais de composition nucléotidique des gènes et épissage alternatif

Date
ven 15 mar 2019
Horaires

14H00

Lieu(x)

Amphi SVT

Intervenant(s)

Soutenance de thèse de M. Sébastien LEMAIRE du Laboratoire BMC sous la direction de M. Didier AUBOEUF

Langue(s) des interventions

Description générale

L’épissage est une étape majeure de l’expression des gènes qui permet après la transcription la production d’ARNm utilisés par les cellules pour la synthèse des protéines. L’épissage consiste en l’élimination des introns et la ligation des exons. La régulation ou des perturbations de ce phénomène sont impliquées dans de nombreuses situations physiopathologiques.

Dans ce travail, j’ai utilisé un grand nombre de données générées à large échelle et l’analyse de  ces données grâce à des approches bio-informatiques permet de mieux définir des règles générales concernant la reconnaissance des exons. Je montre en effet que les mécanismes de reconnaissance des exons dépendent du biais de la composition nucléotidique des gènes qui les hébergent. Ainsi, des exons au sein de gènes très riche en guanine et cytosine sont essentiellement reconnus par leur site 5’ d’épissage. Des exons au sein de gènes très riche en thymine et adénine sont essentiellement reconnus par leur site 3’ d’épissage. Je montre également que l’organ

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