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Étude de la fonction de l’histone méthyltransférase SET-2 et de ses interacteurs dans le maintien de la lignée germinale de Caenorhabditis elegans

Date
ven 28 juin 2019
Horaires

14h00

Intervenant(s)

Soutenance de thèse de Mme Marion HERBETTE du LBMC de l'ENS de lyon, sous la direction de Mme Valérie ROBERT

Langue(s) des interventions

Description générale

Les modifications post-traductionnelles des histones contribuent à la plupart des processus cellulaires dépendants de l’ADN. La méthylation de la lysine 4 de l’histone H3 est associée avec les promoteurs de gènes transcrits. Cependant, sa fonction dans un contexte développemental reste peu connu. Chez Caenorhabditis elegans, SET-2 est responsable de la déposition de H3K4 méthylé dans le soma et la lignée germinale. Le but de mon travail de thèse était d’étudier comment SET-2 contribue au maintien de la lignée germinale.
    L’inactivation de set-2 provoque une perte progressive de la fertilité au cours des générations. J’ai testé si ce phénomène est associé à l’accumulation de dommages à l’ADN dans la lignée germinale. J’ai montré que même si l’absence de SET-2 engendre une sensibilité accrue aux dommages à l’ADN, les voies de signalisation et de réparation de ces dommages sont fonctionnelles. Confirmant ce résultat, je n’ai pas observé l’accumulation de mutations par séquençage. Mes résultats suggèrent que H3K4me pourrait agir en aval de la signalisation de dommages à l’ADN, en influençant l’organisation de la chromatine aux sites des cassures double-brin. J’ai d’ailleurs montré que set-2 interagit génétiquement avec le complexe condensine II et la topoisomérase II, facteurs clefs de l’organisation des chromosomes.
    L’équipe a montré que la sous-unité CFP-1 du complexe SET-2 interagit avec le complexe SIN3/histone déacétylase. Par des analyses transcriptomiques, j’ai aussi mis en évidence une fonction de SIN-3, et à un moindre degré, de CFP-1 dans la répression du chromosome X dans la lignée germinale, une fonction essentielle pour la fertilité.

Gratuit
Mots clés
Disciplines