Les complexes histones méthyltransférases SET1, hautement conservés de la levure aux mammifères, sont ciblés aux régions promotrices par la protéine CFP1/CXXC, résultant en l’implémentation de la méthylation de la lysine 4 de l'histone H3 (H3K4me), modification post-traductionnelle influençant l’expression des gènes selon le contexte chromatinien. La présence de plusieurs complexes SET1 distincts dans différents systèmes modèles eucaryotes a compliqué l’étude de leurs fonctions dans un contexte développemental. Caenorhabditis elegans contient une seule protéine homologue de SET1, SET-2, et d’uniques homologues des autres sous-unités du complexe, RBBP5, ASH2, WDR5, DPY30 et CFP1. Cependant, la composition biochimique du complexe n'a pas été décrite. En couplant des expériences de co-immunoprécipitation avec des analyses de spectrométrie de masse, j'ai identifié le complexe SET-2/SET1 dans les embryons de C. elegans. D'autre part, j'ai montré que CFP-1 co-immunoprécipite aussi le complexe conservé histone déacétylase Sin3S, que j'ai identifié pour la première fois chez C. elegans. J’ai aussi montré que CFP-1 interagit directement avec SIN-3 et ATHP-1, homologues de deux sous-unités du complexe Sin3S chez C. elegans. Mon analyse génétique a démontré que les mutants de perte de fonction des sous-unités des complexes SET-2/SET1 et SIN-3S partagent des phénotypes communs, en cohérence avec des fonctions développementales communes. Nous avons montré que CFP-1 et SIN-3 coopèrent pour moduler l'expression d'un groupe de gènes communs et que CFP-1 favorise le recrutement du complexe SIN-3S au niveau des régions promotrices enrichies en H3K4me3. Ainsi, ces résultats révèlent un rôle nouveau de CFP-1 montrant son interaction physique et sa coopération fonctionnelle avec le complexe SIN-3S au niveau des régions promotrices des gènes pour influencer leur expression mais aussi pour réguler le développement du soma et de la lignée germinale chez C. elegans.
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