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Agenda de l'ENS de Lyon

La protéine C du virus Nipah : mécanismes d'expression et implications virales

Date
mar 27 fév 2024
Horaires

14h

Lieu(x)
Amphithéâtre Pasteur

Tour Inserm CERVI CIRI
21 avenue Tony Garnier
69365 Lyon Cedex 07

Intervenant(s)

Soutenance de thèse de monsieur CHAN MINE Emeric. Sous la direction de monsieur VOLCHKOV Viktor. Sous la co-direction de monsieur JAMIN Marc.

Organisateur(s)
Langue(s) des interventions
Description générale

Le virus Nipah (NiV) est un virus à ARN à polarité négative non segmenté appartenant à la famille des Paramyxoviridae. Le génome de NiV ne comporte que 6 gènes, mais code pour 9 protéines différentes. Plusieurs protéines sont exprimées à partir du gène P dont la phosphoprotéine P et la protéine C. La protéine C, exprimée à partir d'un cadre de lecture ouvert alternatif par le mécanisme du balayage fuyant ribosomique a un rôle encore mal compris dans la réplication virale. Pour étudier sa fonction, de nombreuses recherches ont été réalisées en caractérisant un NiV recombinant déficient dans l’expression de C (rNiV CKO) où les codons initiateurs de C ont été supprimés, sans altérer les autres cadres de lecture des protéines issues du gène P. Nous avons émis l’hypothèse que l’absence du site d’initiation de la traduction de C, n’empêche pas le mécanisme de balayage ribosomal déficient et que ces mutations entraînent une désorganisation de l’expression des protéines exprimées à partir du gène P. Nous avons confirmé cette hypothèse en démontrant que le rNiV CKO, exprime des formes tronquées des protéines C (C') et P (P'). Par ailleurs, notre évaluation comparative du rNiV CKO et du NiV sauvage (WT) a révélé que le rNiV CKO produit des particules virales moins infectieuses ce qui a orienté notre recherche vers l'impact des protéines C, C’ et P’ sur la réplication virale. Nous avons développé un système de miniréplicon NiV et étudié l’effet de ces protéines sur l’activité de la polymérase virale de ce système. C et C' ont montré une régulation négative de l'activité de la polymérase, avec une régulation plus marquée par C'. De plus, nous avons observé des différences de localisation cellulaire entre C et C', cette dernière se localisant dans les corps d'inclusion en présence de protéines virales impliquées dans la synthèse de l'ARN. Concernant la protéine tronquée de P, P’, bien qu'elle ait perdu sa fonction principale de liaison aux nucléoprotéines monomériques, aucun effet dominant négatif n'a été observé sur l'activité de la polymérase NiV. De surcroît, un mélange de P’ et de P dépourvues de leur domaine C-terminal Px peut efficacement substituer la P sauvage dans le système de miniréplicon, offrant ainsi de nouvelles clés de compréhension sur le mécanisme de réplication du NiV. En conclusion, nos résultats, ensemble, suggèrent que l'organisation de l'expression du gène P de NiV est complexe, probablement en raison de deux exigences interdépendantes : la synthèse de C dépend d'une initiation faible de la traduction de P, et la présence d'un ORF ouvert pour C est nécessaire pour prévenir une expression potentiellement aberrante de formes tronquées de C et de P.

Gratuit

Mots clés

Disciplines