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Principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS)

Type Formation qualifiante
Discipline(s) Biologie Chimie
Ouvert à

Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens

Tarif

840 euros

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Objectifs de la formation

  • Connaître les principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS)
  • Être capable de choisir la technologie adaptée à son projet

Intervenant

Ingénieurs CNRS - ENS de Lyon

Programme

Déroulement de la formation

  • 1,5 jour (10 heures)

Contenu de la formation

Présentation des différentes méthodes de séquençage et haut débit (Solid, illumina, Ion torrent, 454 roche, Pacific biosciences…)  

  • Principe et fonctionnement  
  • Capacités de séquençage  
  • Comparatif des différentes méthodes, forces et faiblesses  
  • Les technologies de demain Les différentes applications NGS : quelle méthode choisir en fonction de son application ?  
  • Génomique  
  • Transcriptomique  
  • Épigénomique  
  • Métagénomique et biodiversité  
  • Conclusions

De l’échantillon à la séquence : les grandes étapes méthodologiques

  • Préparation des échantillons
  • Extraction des ADN et ARN  
  • Les différentes approches d’amplification par PCR  
  • Les méthodes de capture et d’enrichissement  
  • Construction des différents types de banques  
  • Fragmentation/Sizing  
  • Les méthodes de purification, d’amplification et de quantification  
  • Séquençage des banques (exemples)

L’analyse des données de séquençage  

  • Les principaux formats de fichiers de sortie de données  
  • Quelques outils d’analyse 
Mots clés