Administrer
documentation:tools:software:braker

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

Les deux révisions précédentesRévision précédente
Prochaine révision		Révision précédente
Prochaine révisionLes deux révisions suivantes
documentation:tools:software:braker [2018/01/30 10:45] – cpetitdocumentation:tools:software:braker [2018/02/06 17:02] – [BRAKER] ltaulell
Ligne 1: Ligne 1:
  
-====== Braker ======+====== BRAKER ======
  
   * Unsupervised RNA-Seq-based genome annotation   * Unsupervised RNA-Seq-based genome annotation
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  2.0.3  |  N/A  |  N/A  |  ''${APPLIS}/Local/BRAKER/2.0.3/bin  |  Generic  |+|  2.0.3  |  N/A  |  N/A  |  ''${APPLIS}/Local/BRAKER/2.0.3/bin''  |  Generic  |
 | | **modulefile** : BRAKER/2.0.3  |||| | | **modulefile** : BRAKER/2.0.3  ||||
-|  1.9  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Braker/1.9/bin  |  Generic  | +
-| | **modulefile** : BRAKER/1.9  ||||+
  
  
Ligne 16: Ligne 15:
  
  
-===== Usage on PSMN =====+==== Usage on PSMN ====
  
 Braker needs additionals PERL modules installable from CPAN (see [[documentation:tools:langages:perl5|Perl5]] for CPAN installation/configuration ): Braker needs additionals PERL modules installable from CPAN (see [[documentation:tools:langages:perl5|Perl5]] for CPAN installation/configuration ):
Ligne 36: Ligne 35:
 See also [[documentation:tools:software:augustus|Augustus]] for additional configuration of ''--AUGUSTUS_CONFIG_PATH'' variable. See also [[documentation:tools:software:augustus|Augustus]] for additional configuration of ''--AUGUSTUS_CONFIG_PATH'' variable.
  
 +
 +==== General usage ====
 +
 +[[documentation:tools:software:augustus|AUGUSTUS]] and [[documentation:tools:software:genemark|GeneMark-ET]]  are required for BRAKER.
  
  
documentation/tools/software/braker.txt · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)
Rechercher
Translations
Piste :
Vous êtes ici : accueil » documentation » tools » software » braker
Navigation
Pôle Scientifique de Modélisation Numérique, ENS de Lyon - 46, allée d'Italie - 69364 Lyon cedex 07 - France
Téléphone : +33 (0)4 72 72 83 67
Sauf mention contraire, le contenu de ce wiki est placé sous les termes de la licence suivante : CC Attribution-Share Alike 4.0 International
Modified Scanlines on DokuWiki under the hood