Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| documentation:tools:software:trimmomatic [2018/07/02 08:04] – cpetit | documentation:tools:software:trimmomatic [2018/07/02 08:04] – [Trimmomatic] cpetit | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 7: | Ligne 7: | ||
| | | **modulefile** : aucun |||| | | | **modulefile** : aucun |||| | ||
| + | <code bash> | ||
| + | TRIMMOMATIC =/ | ||
| + | java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | ||
| + | </ | ||
| <code bash> | <code bash> | ||
| Ligne 12: | Ligne 16: | ||
| # Paired End | # Paired End | ||
| java -jar <path to trimmomatic.jar> | java -jar <path to trimmomatic.jar> | ||
| + | < | ||
| + | |||
| - | TRIMMOMATIC =/ | ||
| - | java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | ||
| - | </ | ||