Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente |
documentation:tools:software:lammps [2019/03/27 16:42] – [Exemples d'utilisation au PSMN] cicaluga | documentation:tools:software:lammps [2020/10/15 07:01] (Version actuelle) – cicaluga |
---|
====== LAMMPS ====== | ====== LAMMPS ====== |
| |
<note warning>update needed</note> | |
| |
| |
^ Version ^ Compilateur ^ Interconnexion ^ chemin d'accès ^ OS ^ | ^ Version ^ Compilateur ^ Interconnexion ^ chemin d'accès ^ OS ^ |
| 7Dec15 | openmpi-1.8.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps/7Dec15/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/bin/lammps | Debian 7 | | | 7Dec15 | openmpi-1.8.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps/7Dec15/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/bin/lammps | Debian 7 | |
| | **modulefile** : Lammps/7Dec15-mpi-1.8.4-intel-14.0.1 |||| | | | **modulefile** : Lammps/7Dec15-mpi-1.8.4-intel-14.0.1 |||| |
| 11Aug17 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/11Aug17/iomkl-2017.4b-3.0.0/bin/ | | | 11Aug17 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/11Aug17/iomkl-2017.4b-3.0.0/bin/ | Debian 7 | |
| | **modulefile** : LAMMPS/11Aug17-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| | | | **modulefile** : LAMMPS/11Aug17-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| |
| 22Aug2018 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/22Aug2018/iomkl-2017.4b-3.0.0/bin/ | | | 22Aug2018 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/22Aug2018/iomkl-2017.4b-3.0.0/bin/ | Debian 9 | |
| | **modulefile** : LAMMPS/22Aug2018-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| | | | **modulefile** : LAMMPS/22Aug2018-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| |
| 15Nov2018 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/15Nov2018/iomkl-2017.4b-3.0.0/bin/ | | | 15Nov2018 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/15Nov2018/iomkl-2017.4b-3.0.0/bin/ | Debian 9 | |
| | **modulefile** : LAMMPS/15Nov2018-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| | | | **modulefile** : LAMMPS/15Nov2018-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| |
| | 19Sep2019 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/19Sep19/iomkl-2017.4-3.0.0/bin/ | Debian 9 | |
| | | **modulefile** : LAMMPS/19Sep2019-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| |
| | 3Mar20 | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/3Mar20/iomkl-2017.4-3.0.0/bin/ | Debian 9 | |
| | | **modulefile** : LAMMPS/3Mar20-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| |
| | 3Mar20 avec GAP et QUIP | openmpi-3.0.0-intel/2017.4 | Infiniband | /applis/PSMN/debian9/software/Local/LAMMPS/3Mar20-quip-gap/iomkl-2017.4-3.0.0/bin/ | Debian 9 | |
| | | **modulefile** : LAMMPS/3Mar20-quip-gap-iomkl-2017.4-3.0.0 |||| |
| |
| |
===== Exemples d'utilisation au PSMN ===== | ===== Exemples d'utilisation au PSMN ===== |
| |
L' exemple décri le mode d'utilisation de LAMMPS en mode parallèle multithreadé (un seul noeud). | L' exemple décri le mode d'utilisation de LAMMPS en mode parallèle MPI. |
| |
| |
- créer un répertoire de test et travailler dedans : <code bash> | - créer un répertoire de test et travailler dedans : <code bash> |
mkdir $HOME/test_lammps | mkdir $HOME/Test_LAMMPS |
cd $HOME/test_lammps </code> | cd $HOME/Test_LAMMPS </code> |
| |
- copier l'un des fichier test dans votre répertoire de test : <code bash> | - copier l'un des fichier test dans votre répertoire de test : <code bash> |