Ceci est une ancienne révision du document !
Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
---|---|---|---|---|
11Nov13 | openmpi-1.6.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps-11Nov13/intel-14.0.1/openmpi-1.6.4/bin/lammps | Debian 7 |
modèle tsch : /applis/PSMN/modeles/Lammps-11Nov13-debian7.csh | ||||
modèle bash : /applis/PSMN/modeles/Lammps-11Nov13-debian7.sh | ||||
modulefile : Lammps/11Nov13-mpi-1.6.4-intel-14.0.1 | ||||
28Jun14 | openmpi-1.6.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps/28Jun14/intel-14.0.1/openmpi-1.6.4/bin/lammps | Debian 7 |
modèle tsch : /applis/PSMN/modeles/Lammps-28Jun14-debian7.csh | ||||
modèle bash : /applis/PSMN/modeles/Lammps-28Jun14-debian7.sh | ||||
modulefile : Lammps/28Jun14-mpi-1.6.4-intel-14.0.1 | ||||
28Jun14 | openmpi-1.8.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps/28Jun14/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/bin/lammps | Debian 7 |
modulefile : Lammps/28Jun14-mpi-1.8.4-intel-14.0.1 | ||||
15May15 | openmpi-1.8.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps/15May15/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/bin/lammps | Debian 7 |
modulefile : Lammps/15May15-mpi-1.8.4-intel-14.0.1 | ||||
7Dec15 | openmpi-1.8.4-intel-14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/Lammps/7Dec15/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/bin/lammps | Debian 7 |
modulefile : Lammps/7Dec15-mpi-1.8.4-intel-14.0.1 |
/applis/PSMN/debian7/Lammps/28Jun14/intel-14.0.1/openmpi-1.6.4
$ cp -r /applis/PSMN/debian7/Lammps/28Jun14/intel-14.0.1/openmpi-1.6.4/bench/ /home/nom_login/bench_lammps $ cd /home/nom_login/bench_lammps $ module load Lammps/28Jun14-mpi-1.8.4-intel-14.0.1 $ mpirun -np 4 lammps < in.lj > log.out
Dans ce qui précède, remplacer nom_login par votre login PSMN, le shell utilisé est tcsh (ou csh) et on charge le modulefile Lammps/28Jun14-mpi-1.8.4-intel-14.0.1
pour configurer l'environnement d'éxecution.
cd lammps-28Jun14 cp MAKE/Makefile.linux MAKE/Makefile.openmpi-1.6.4-intel-14.0.1-debian7
CC = mpic++ CCFLAGS = -O2 LINK = mpic++ MPI_INC, MPI_PATH, MPI_LIB = FFT_INC, FFT_PATH, FFT_LIB =
$ make yes-class2 $ make yes-molecule $ make yes-rigid $ make yes-user-cg-cmm $ make yes-user-omp
make openmpi-1.6.4-intel-14.0.1-debian7