Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédenteDernière révisionLes deux révisions suivantes | ||
documentation:tools:software:trimmomatic [2018/07/02 08:04] – [Trimmomatic] cpetit | documentation:tools:software:trimmomatic [2018/10/09 04:45] – cicaluga | ||
---|---|---|---|
Ligne 8: | Ligne 8: | ||
<code bash> | <code bash> | ||
- | TRIMMOMATIC =/ | + | # usage type |
+ | TRIMMOMATIC=/ | ||
java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | ||
</ | </ | ||
<code bash> | <code bash> | ||
+ | ## Example | ||
## Quick start | ## Quick start | ||
# Paired End | # Paired End | ||
java -jar <path to trimmomatic.jar> | java -jar <path to trimmomatic.jar> | ||
- | < | + | </code> |