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documentation:tools:software:trinity [2018/04/20 09:13] – [Trinity] cpetitdocumentation:tools:software:trinity [2020/08/25 15:58] – modification externe 127.0.0.1
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 |  2.6.6  |  GCC/6.3.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Local/Trinity/2.6.6  |  Debian 9  | |  2.6.6  |  GCC/6.3.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Local/Trinity/2.6.6  |  Debian 9  |
 | | **modulefile** : Trinity/2.6.6  |||| | | **modulefile** : Trinity/2.6.6  ||||
-|  2.5.1  |  GCC/6.4.0 - OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/MPI/GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/Trinity/2.5.1/trinityrnaseq-Trinity-v2.5.1  |  Debian 9  | +|  2.5.1  |  GCC/6.4.0 - OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Local/Trinity/2.5.1  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/Trinity/2.5.1  ||||+| | **modulefile** : Trinity/2.5.1  ||||
 |  2.2.0  |  gcc-6.3.0  |  N/A  |  /usr/bin  |  Debian 9  | |  2.2.0  |  gcc-6.3.0  |  N/A  |  /usr/bin  |  Debian 9  |
 | | **modulefile** : aucun  |||| | | **modulefile** : aucun  ||||
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 ### Modulefiles ### Modulefiles
-source /usr/share/modules/init/bash +source /usr/share/lmod/lmod/init/bash 
-module use /applis/PSMN/Modules +module load Trinity/2.5.1
-module load Base/psmn +
-module load Trinity/r20140413+
 # #
  
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 SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch} SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch}
 mkdir -p $SCRATCHDIR mkdir -p $SCRATCHDIR
- 
  
  
documentation/tools/software/trinity.txt · Dernière modification : 2022/09/13 12:36 de ltaulell