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Soutenance d’HDR:Les modes normaux de basse fréquence des protéines
par Webmaster - 5 novembre 2007
Orateur :
Yves-Henri Sanejouand, Laboratoire Joliot-Curie et Laboratoire de Physique, ENS-Lyon
Salle :
Salle des thèses
Sujet :
Les mouvements de basse fréquence des protéines, tels qu’on peut les calculer via l’approximation des petits déplacements (approximation harmonique), ressemblent souvent beaucoup à leurs mouvements fonctionnels, tels qu’on peut les observer par cristallographie des rayons X. Ce résultat semble très robuste puisqu’il a été obtenu, tout d’abord, en partant d’une description des protéines à l’échelle atomique puis, plus récemment, en partant de descriptions à "gros grains" (des modèles de type réseau élastique).
Partant de ce constat, des applications ont été proposées, notamment pour faciliter la résolution de structures ou pour améliorer leur qualité (ajustement dans des enveloppes obtenues par cryomicroscopie électronique, remplacement moléculaire...). Je ferai une revue des résultats obtenus, dans laquelle mes contributions seront plus particulièrement mises en avant.
Parmi les développements les plus récents, seront évoquées des tentatives de faire le lien entre modèles à l’échelle atomique et modèles à gros grains, ou bien de complexifier ces derniers, en y incluant des termes anharmoniques.
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