New Documentation (Debian 11 / Slurm)
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Pour des petits tests, vous pouvez utiliser les logiciels ci-dessous en interactif, sur les frontales. Sinon, utilisez le système de batch.
N'oubliez pas de configurer votre environnement :
~/.cshrc, ~/.bashrc, soit dans vos scripts.Les librairies sont décrites sur cette page.
Quelques trucs et astuces pour les langages interprétés.
Un grand nombre des logiciels déjà installés ne sont pas listés ici.
Cherchez d'abord dans /usr/bin/ (standard),
et /applis/PSMN/generic/ ou /applis/PSMN/debian9/software (new 2018)
Un serveur dédié à la visualisation (OpenGL/Mesa/CUDA) est disponible au PSMN : r740visu
(classés par science d'origine… ou pas.)
Une liste de discussion dédiée aux usages bio-info sur la plate-forme du PSMN est disponible : bioinfo.psmn @ listes.ens-lyon.fr.
Voir un tri par mots clés des logiciels bioinformatiques.