Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente | ||
documentation:tools:software:abinit [2020/10/21 10:09] – cicaluga | documentation:tools:software:abinit [2021/06/22 08:26] (Version actuelle) – [Abinit] cicaluga | ||
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Ligne 8: | Ligne 8: | ||
| 8.6.3 | openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4 | | 8.6.3 | openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4 | ||
| 8.10.3 | | 8.10.3 | ||
+ | | 9.4.1 | openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4 | ||
Ligne 58: | Ligne 59: | ||
- | - Rapatriement du tutoriel dans le compte utilisateur | + | * Rapatriement du tutoriel dans le compte utilisateur |
<code bash> | <code bash> | ||
Ligne 69: | Ligne 70: | ||
</ | </ | ||
- | - Définition de l' | + | * Définition de l' |
<code bash> | <code bash> | ||
Ligne 76: | Ligne 77: | ||
</ | </ | ||
- | - Exécution de l' | + | * Exécution de l' |
<code bash> | <code bash> | ||
$ mpirun -np 4 abinit < tdfpt_01.files > tdfpt_01.log | $ mpirun -np 4 abinit < tdfpt_01.files > tdfpt_01.log | ||
</ | </ | ||
- | - Exécution du calcul DFPT | + | * Exécution du calcul DFPT |
+ | |||
<code bash> | <code bash> | ||
$ cp tdfpt_01.o_WFK tdfpt_02.i_WFK | $ cp tdfpt_01.o_WFK tdfpt_02.i_WFK | ||
Ligne 90: | Ligne 93: | ||
A la fin de l' | A la fin de l' | ||
+ | |||
+ | < | ||
< | < | ||
- | - Lancement en mode Batch | + | * Lancement en mode Batch |
Les étapes précédentes étant exécutées en mode Interactif, mais pour plus de rapidité et pour poursuivre les calculs en mode production, ces étapes sont à exécuter en mode Batch (soumission aux queues SGE), en soumettant un script de soumission classique ABINIT, comme suit : | Les étapes précédentes étant exécutées en mode Interactif, mais pour plus de rapidité et pour poursuivre les calculs en mode production, ces étapes sont à exécuter en mode Batch (soumission aux queues SGE), en soumettant un script de soumission classique ABINIT, comme suit : | ||
Ligne 130: | Ligne 135: | ||
## | ## | ||
## | ## | ||
+ | NSLOTS=4 | ||
###### First test | ###### First test | ||
## | ## | ||
Ligne 139: | Ligne 145: | ||
## | ## | ||
## | ## | ||
- | ###### | + | ###### |
## | ## | ||
$MPIRUN -v -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile ${HOSTFILE} -np ${NSLOTS} abinit < tdfpt_03.files > tdfpt_03.log | $MPIRUN -v -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile ${HOSTFILE} -np ${NSLOTS} abinit < tdfpt_03.files > tdfpt_03.log |