Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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documentation:tools:software:abinit [2020/10/21 10:11] – [Tutoriel ABINIT "tutoparal"] cicalugadocumentation:tools:software:abinit [2021/06/22 08:26] (Version actuelle) – [Abinit] cicaluga
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 |  8.6.3  |  openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | /applis/PSMN/debian9/software/Local/ABINIT/8.6.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6/bin |  Debian 9  | ABINIT/8.6.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | |  8.6.3  |  openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | /applis/PSMN/debian9/software/Local/ABINIT/8.6.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6/bin |  Debian 9  | ABINIT/8.6.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  |
 |  8.10.3  |  openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | /applis/PSMN/debian9/software/Local/ABINIT/8.10.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4/bin |  Debian 9  | ABINIT/8.10.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | |  8.10.3  |  openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | /applis/PSMN/debian9/software/Local/ABINIT/8.10.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4/bin |  Debian 9  | ABINIT/8.10.3/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  |
 +|  9.4.1  |  openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  | /applis/PSMN/debian9/software/Local/ABINIT/9.4.1/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4/bin |  Debian 9  | module load ABINIT/9.4.1/openmpi-3.0.0-gcc-7.2.0-fftw-3.3.6-mkl-2017.4  |
  
  
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 </code> </code>
  
-  - Exécution de l'étape préparatoire +    * Exécution de l'étape préparatoire  
 <code bash> <code bash>
 $ mpirun -np 4 abinit < tdfpt_01.files > tdfpt_01.log $ mpirun -np 4 abinit < tdfpt_01.files > tdfpt_01.log
 </code> </code>
  
-  - Exécution du calcul DFPT +    * Exécution du calcul DFPT 
 + 
 <code bash> <code bash>
 $ cp tdfpt_01.o_WFK tdfpt_02.i_WFK $ cp tdfpt_01.o_WFK tdfpt_02.i_WFK
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 A la fin de l'exécution, les fichiers de sortie peuvent être comparés à ceux de référence fournis dans le répertoire Refs.  A la fin de l'exécution, les fichiers de sortie peuvent être comparés à ceux de référence fournis dans le répertoire Refs. 
  
 +
 +<note> Les étapes précédents correspondent au premier cas test du tutoriel ; le second cas test peut être lancé de la même manière, mais étant donné le temps CPU important requis (plusieurs heures de calcul), il est préconisé de le lancer en mode Batch cf. ci-dessous </note>
 <note> Le calcul MBT suit les mêmes étapes </note> <note> Le calcul MBT suit les mêmes étapes </note>
  
-  - Lancement en mode Batch +    * Lancement en mode Batch 
  
 Les étapes précédentes étant exécutées en mode Interactif, mais pour plus de rapidité et pour poursuivre les calculs en mode production, ces étapes sont à exécuter en mode Batch (soumission aux queues SGE), en soumettant un script de soumission classique ABINIT, comme suit : Les étapes précédentes étant exécutées en mode Interactif, mais pour plus de rapidité et pour poursuivre les calculs en mode production, ces étapes sont à exécuter en mode Batch (soumission aux queues SGE), en soumettant un script de soumission classique ABINIT, comme suit :
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 ## ##
 ## ##
 +NSLOTS=4
 ###### First test ###### First test
 ##Preparatory step 1 ##Preparatory step 1
Ligne 139: Ligne 145:
 ## ##
 ## ##
-###### First test+###### Second test
 ##Preparatory step 1 ##Preparatory step 1
 $MPIRUN -v -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile ${HOSTFILE} -np ${NSLOTS} abinit < tdfpt_03.files > tdfpt_03.log $MPIRUN -v -x LD_LIBRARY_PATH -hostfile ${HOSTFILE} -np ${NSLOTS} abinit < tdfpt_03.files > tdfpt_03.log
documentation/tools/software/abinit.1603275089.txt.gz · Dernière modification : 2020/10/21 10:11 de cicaluga