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documentation:tools:software:bismark

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documentation:tools:software:bismark [2016/02/05 09:07] – [Doc Admin-sys PSMN] ltaulelldocumentation:tools:software:bismark [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
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 ====== Bismark ====== ====== Bismark ======
  
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ +  * A tool to map bisulfite converted sequence reads and determine cytosine methylation states 
-|  0.15.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/  |  Debian 7  | + 
-| | **modulefile** : Bismark/0.15.0  ||||+ 
 +^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^ 
 +|  0.18.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.18.0/bin/  | 
 +| | **modulefile** : Bismark/0.18.0  ||| 
 +|  0.15.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/  | 
 +| | **modulefile** : Bismark/0.15.0  |||
  
 Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
  
-{{INLINETOC}} 
  
-===== Site officiel ===== 
  
-  * http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/bismark/ 
  
 ==== Doc Admin-sys PSMN ==== ==== Doc Admin-sys PSMN ====
  
-Dépendances sur ''Bowtie/2.2.4'' et ''SAMtools/1.1'' inclusent dans le modulefile.+   * Dépendances sur ''Bowtie/2.3.3'' et ''SAMtools/1.6'' incluses dans les modulefile ''Bismark/0.18.0'' et ''Bismark/0.15.0''. 
 + 
 + 
 + 
 + 
 + 
 +===== Site officiel ===== 
 + 
 +  * https://github.com/FelixKrueger/Bismark 
 +  * http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/bismark/ 
documentation/tools/software/bismark.1454663235.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)
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