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Bismark
- A tool to map bisulfite converted sequence reads and determine cytosine methylation states
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 0.15.0 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/ | Debian 7 |
| modulefile : Bismark/0.15.0 | ||||
| 0.18.0 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/Bismark/0.18.0/bin/ | Debian 7 |
| modulefile : Bismark/0.18.0 | ||||
Pour utiliser les modulefiles, consulter Environment Modules
Doc Admin-sys PSMN
- Dépendances sur
Bowtie/2.2.4etSAMtools/1.1incluses dans le modulefile Bismark/0.15.0. - Dépendances sur
Bowtie/2.3.3etSAMtools/1.3.1incluses dans le modulefile Bismark/0.18.0.