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 ====== Bismark ====== ====== Bismark ======
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-<note warning>update needed</note> 
- 
  
   * A tool to map bisulfite converted sequence reads and determine cytosine methylation states   * A tool to map bisulfite converted sequence reads and determine cytosine methylation states
  
  
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès   OS  ^ +^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès 
-|  0.18.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.18.0/bin/   Debian 7  | +|  0.18.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.18.0/bin/ 
-| | **modulefile** : Bismark/0.18.0  |||| +| | **modulefile** : Bismark/0.18.0  ||| 
-|  0.15.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/   Debian 7  | +|  0.15.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/Bismark/0.15.0/bin/ 
-| | **modulefile** : Bismark/0.15.0  ||||+| | **modulefile** : Bismark/0.15.0  |||
  
 Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modulefiles, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
  
-{{INLINETOC}}+
  
  
 ==== Doc Admin-sys PSMN ==== ==== Doc Admin-sys PSMN ====
  
-   * Dépendances sur ''Bowtie/2.3.3'' et ''SAMtools/1.3.1'' incluses dans le modulefile ''Bismark/0.18.0''+   * Dépendances sur ''Bowtie/2.3.3'' et ''SAMtools/1.6'' incluses dans les modulefile ''Bismark/0.18.0'' et ''Bismark/0.15.0''. 
-   * Dépendances sur ''Bowtie/2.2.4'' et ''SAMtools/1.1'' incluses dans le modulefile ''Bismark/0.15.0''.+
  
  
documentation/tools/software/bismark.1519744943.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)