Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente | ||
| documentation:tools:software:canu [2017/01/23 10:55] – ltaulell | documentation:tools:software:canu [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | <note warning> | + | <note warning> |
| - | ====== | + | ====== |
| + | |||
| + | * a fork of the [[documentation: | ||
| ^ Version | ^ Version | ||
| - | | | + | | |
| - | | | **modulefile** : Celera/WGS-8.3rc2 |||| | + | | | **modulefile** : Canu/1.4 |||| |
| Pour utiliser les modulefiles, | Pour utiliser les modulefiles, | ||
| - | <note important> | + | <note important> |
| * canu.defaults " | * canu.defaults " | ||
| < | < | ||
| - | maxMemory=256 | + | maxMemory = 250 |
| - | maxThreads=16 | + | maxThreads = 16 |
| - | useGrid=remote | + | useGrid = remote |
| - | gridEngine=sge | + | gridEngine = sge |
| - | gridEngineArrayMaxJobs=7500 | + | gridEngineArrayMaxJobs = 7500 |
| - | gridEngineThreadsOption="-pe openmp16 | + | gridEngineThreadsOption = -pe openmp16 |
| + | gridEngineMemoryOption = -l h_vmem=MEMORY | ||
| </ | </ | ||
| - | {{INLINETOC}} | + | |
| ==== Doc Admin-sys PSMN ==== | ==== Doc Admin-sys PSMN ==== | ||
| - | | + | Canu est un fork de [[documentation: |
| - | * http://wgs-assembler.sourceforge.net/wiki/index.php? | + | |
| + | | ||
| + | * http://canu.readthedocs.io/en/stable/index.html | ||
| + | |||