Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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documentation:tools:software:canu [2017/01/23 10:56] – [Doc Admin-sys PSMN] ltaulell | documentation:tools:software:canu [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 | ||
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- | <note warning> | + | <note warning> |
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+ | * a fork of the [[documentation: | ||
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- | | | **modulefile** : Celera/WGS-8.3rc2 |||| | + | | | **modulefile** : Canu/1.4 |||| |
Pour utiliser les modulefiles, | Pour utiliser les modulefiles, | ||
- | <note important> | + | <note important> |
* canu.defaults " | * canu.defaults " | ||
< | < | ||
- | maxMemory=256 | + | maxMemory = 250 |
- | maxThreads=16 | + | maxThreads = 16 |
- | useGrid=remote | + | useGrid = remote |
- | gridEngine=sge | + | gridEngine = sge |
- | gridEngineArrayMaxJobs=7500 | + | gridEngineArrayMaxJobs = 7500 |
- | gridEngineThreadsOption="-pe openmp16 | + | gridEngineThreadsOption = -pe openmp16 |
+ | gridEngineMemoryOption = -l h_vmem=MEMORY | ||
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- | {{INLINETOC}} | + | |
==== Doc Admin-sys PSMN ==== | ==== Doc Admin-sys PSMN ==== | ||
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+ | Canu est un fork de [[documentation: | ||
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