Ceci est une ancienne révision du document !


FASTX-Toolkit

  • The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for Short-Reads FASTA/FASTQ files preprocessing.
Version Compilateur Interconnexion chemin d'accès OS
0.0.14 GCC/7.2.0 N/A ${APPLIS}/Compiler/GCC/7.2.0/FASTX-Toolkit/0.0.14 Debian 9
modulefile : GCC/7.2.0/FASTX-Toolkit/0.0.14
APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software

Site officiel

Remarques d'utilisation

  • La version 0.0.14 utilise des fastq en version Phred33, alors que les plus anciennes versions de FASTK-Tools utilisaient phred64. L'option -Q64 permet de revenir au comportement des versions antérieures.
documentation/tools/software/fastx-toolkit.1518614664.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)