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documentation:tools:software:gromacs [2018/02/27 15:05] – ltaulell | documentation:tools:software:gromacs [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 |
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====== Gromacs ====== | ====== Gromacs ====== |
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<note warning>update needed</note> | |
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^ Version ^ Compilateur ^ Interconnexion ^ chemin d'accès ^ OS ^ | ^ Version ^ Compilateur ^ Interconnexion ^ chemin d'accès ^ OS ^ |
| 5.0.5 | openmpi 1.8.4 / intel 14.0.1 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/gromacs/5.0.5/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/ | Debian 7 | | | 2018.1 | IntelComp/2017.4/OpenMPI/3.0.0 | | /applis/PSMN/debian9/software/Local/Gromacs/2018.1/IntelComp-2017.4-OpenMPI-3.0.0 | Debian 9 | |
| | **modulefile** : gromacs/5.0.5 |||| | | | **modulefile** : Gromacs/2018.1/IntelComp-2017.4-OpenMPI-3.0.0 ||| |
| 2016.3 | openmpi 2.01 / intel 15.0.2 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/gromacs/2016.3/intel-15.0.2/openmpi-2.0.1/ | Debian 7 | | | 2016.3 | | | /usr/bin/ | Debian 9 | |
| | **modulefile** : gromacs/2016.3 |||| | | | **modulefile** : aucun ||| |
| 2016.3 | intel 15.0.2 / CUDA 5.5 | Infiniband | /applis/PSMN/debian7/gromacs/2016.3/intel-15.0.2/cuda-5.5/ | Debian 7 | | |
| | **modulefile** : gromacs/2016.3+cuda5. |||| | |
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Gromacs utilise un initiateur, ''GMXRC'', situé dans ''/applis/PSMN/debian7/gromacs/5.0.5/intel-14.0.1/openmpi-1.8.4/bin/'' pour la version 5.0.5 et dans ''/applis/PSMN/debian7/gromacs/2016.3/intel-15.0.2/openmpi-2.0.1/bin/'' pour la version 2016.3. | Gromacs utilise un initiateur, ''GMXRC'', situé dans ''/applis/PSMN/debian9/software/Local/Gromacs/2018.1/IntelComp-2017.4-OpenMPI-3.0.0/bin/GMXRC'' pour la version 2018.1. |
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Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] | Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] |
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