Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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documentation:tools:software:gubbins [2017/03/31 13:01] – [Site officiel] cpetit | documentation:tools:software:gubbins [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 | ||
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====== Gubbins ====== | ====== Gubbins ====== | ||
- | * Gubbins (Genealogies Unbiased By recomBinations In Nucleotide Sequences) is an algorithm that iteratively identifies loci containing elevated densities | + | * **G**enealogies **U**nbiased **B**y recom**B**inations **I**n **N**ucleotide **S**equences, |
^ Version | ^ Version | ||
- | | 2.2.0 | gcc 4.7.2 | + | | 2.2.0 | gcc 6.3.0 |
- | | | **modulefile** : gubbins/2.2.0 |||| | + | | | **modulefile** : N/A |||| |
Pour utiliser les modules, consulter [[documentation: | Pour utiliser les modules, consulter [[documentation: | ||
- | {{INLINETOC}} | + | |
===== Site officiel ===== | ===== Site officiel ===== | ||
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* https:// | * https:// | ||
* http:// | * http:// | ||
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+ | Gubbins is an algorithm that iteratively identifies loci containing elevated densities of base substitutions while concurrently constructing a phylogeny based on the putative point mutations outside of these regions. |