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documentation:tools:software:gubbins [2017/03/31 13:03] – [Gubbins] cpetitdocumentation:tools:software:gubbins [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
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 ====== Gubbins ====== ====== Gubbins ======
  
-  * **G**enealogies **U**nbiased **B**y recom**B**inations **I**n **N**ucleotide **S**equences, is an algorithm that iteratively identifies loci containing elevated densities of base substitutions while concurrently constructing a phylogeny based on the putative point mutations outside of these regions.+  * **G**enealogies **U**nbiased **B**y recom**B**inations **I**n **N**ucleotide **S**equences, phylogenetic analysis of large samples of recombinant bacterial whole genome sequences
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  2.2.0  |  gcc 4.7.  N/A  |  /applis/PSMN/debian7/gubbins/2.2.0/full-debian7/bin  |  Debian  | +|  2.2.0  |  gcc 6.3.  N/A  |  /usr/bin  |  Debian  | 
-| | **modulefile** : gubbins/2.2.0  ||||+| | **modulefile** : N/ ||||
  
  
 Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
  
-{{INLINETOC}}+
  
 ===== Site officiel ===== ===== Site officiel =====
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   * https://github.com/sanger-pathogens/gubbins/   * https://github.com/sanger-pathogens/gubbins/
   * http://sanger-pathogens.github.io/gubbins/   * http://sanger-pathogens.github.io/gubbins/
 +
 +Gubbins is an algorithm that iteratively identifies loci containing elevated densities of base substitutions while concurrently constructing a phylogeny based on the putative point mutations outside of these regions.
documentation/tools/software/gubbins.1490965428.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)