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HISAT
- a fast and sensitive spliced alignment program for mapping RNA-seq reads.
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 2.1.0 | GCC-7.2.0 | N/A | ${SITE}/MPI/GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/HISAT2/2.1.0 | node9 |
modulefile : GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/HISAT2/2.1.0 |
||||
| 2.0.5 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/HISAT/2.0.5 | generic |
| modulefile : HISAT/2.0.5 | ||||
| 2.0.0-beta | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/HISAT/2.0.0-beta | generic |
| modulefile : HISAT/2.0.0b | ||||
| 0.1.5-beta | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/HISAT/0.1.5-beta | generic |
| modulefile : HISAT/0.1.5b | ||||
Pour utiliser les modulefiles, consulter Environment Modules
$SITE = /applis/PSMN/debian9/software