Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

Prochaine révision
Révision précédente
documentation:tools:software:picard [2015/11/16 10:40] – créée ltaulelldocumentation:tools:software:picard [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
Ligne 1: Ligne 1:
 ====== Picard ====== ====== Picard ======
 +
 +  * a set of command line tools for manipulating high-throughput sequencing (HTS) data and formats such as SAM/BAM/CRAM and VCF.
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
 +|  2.8.1  |  java-1.8.0_151  |  N/A  |  /usr/bin  |  N/A  |
 +| | **modulefile** : picard/2.3.0  ||||
 +|  2.3.0  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/picard/2.3.0/  |  N/A  |
 +| | **modulefile** : picard/2.3.0  ||||
 +
 +<hidden>
 |  1.140  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/picard/1.140/  |  N/A  | |  1.140  |  N/A  |  N/A  |  /applis/PSMN/generic/picard/1.140/  |  N/A  |
 | | **modulefile** : picard/1.140  |||| | | **modulefile** : picard/1.140  ||||
 +</hidden>
  
 Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
  
-{{INLINETOC}}+Usage : 
 +''$PICARD'' est une variable d'environnement exposée par le modulefile ''picard/<version>''
 + 
 +<code bash> 
 +java -jar $PICARD --help 
 + 
 +ou 
 + 
 +java -jar $PICARD PicardTool --help 
 +</code> 
 + 
 + 
 + 
 + 
 + 
  
 ===== Site officiel ===== ===== Site officiel =====
  
   * http://broadinstitute.github.io/picard/   * http://broadinstitute.github.io/picard/
documentation/tools/software/picard.1447670433.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)