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documentation:tools:software:rsem

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documentation:tools:software:rsem [2015/02/11 15:45] – créée ltaulelldocumentation:tools:software:rsem [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
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 ====== RSEM ====== ====== RSEM ======
 +
 +  * **R**NA-**S**eq by **E**xpectation-**M**aximization, accurate transcript quantification from RNA-Seq data with or without a reference genome.
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  1.2.19  |  gcc 4.7.2  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian7/RSEM/1.2.19  |  Debian 7  | +|  1.3.0  |  GCC/7.2.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Compiler/GCC/7.2.0/RSEM/1.3.0 |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : RSEM/1.2.19  ||||+| | **modulefile** : GCC/7.2.0/RSEM/1.3.0  |||| 
 +|  1.2.31  |  gcc-6.3.0  |  N/A  |  /usr/bin |  Debian 9  | 
 +| | **modulefile** : aucun  ||||
  
  
-<note important>Le modulefile charge les dépendances ''Bowtie/2.2.4'' et ''R/3.0.2''</note>+ 
 +<note important> 
 +Le modulefile ''GCC/7.2.0/RSEM/1.3.0'' charge les dépendances : 
 +  * ''GCC/6.4.0/Bowtie2/2.3.3''  
 +  * ''R/3.4.0''. \\ 
 + 
 +</note> 
  
  
-{{INLINETOC}} 
  
 ===== Site officiel ===== ===== Site officiel =====
  
   * http://deweylab.biostat.wisc.edu/rsem/   * http://deweylab.biostat.wisc.edu/rsem/
 +
documentation/tools/software/rsem.1423669521.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)
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