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documentation:tools:software:samtools [2014/10/07 12:59] ltaulelldocumentation:tools:software:samtools [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
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 ====== SAMtools ====== ====== SAMtools ======
 +
 +   * a tool for interacting with high-throughput sequencing data. It enables the reading/writing/editing/indexing/viewing of files in SAM/BAM/CRAM format.
  
 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  0.1.18  |  N/  N/A  |  /usr/bin |  Debian  | +|  1.3.6  |  GCC/7.2.0   N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/MPI/GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/SAMtools/1.6 |  Debian  | 
-| | **modulefile** : Base/psmn  |||| +| | **modulefile** : GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/SAMtools/1.6  |||| 
-|  1. |  gnu-4.7.2   N/A  |  /applis/PSMN/debian7/SAMtools/1.1/bin |  Debian  | +|  1.3.6  |  GCC/6.4.  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/MPI/GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/SAMtools/1.6 |  Debian  | 
-| | **modulefile** : SAMtools/1.1  ||||+| | **modulefile** : GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/SAMtools/1.6  |||| 
 +|  1.3.1  |  gcc-6.3.0   N/A   /usr/bin   Debian 9  | 
 +| | **modulefile** : aucun  |||| 
 + 
  
 Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
  
-{{INLINETOC}}+
  
  
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   * http://www.htslib.org/download/   * http://www.htslib.org/download/
 +
 +===== Site officiel =====
 +   * http://www.htslib.org/
 +
 +
documentation/tools/software/samtools.1412686746.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)