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TopHat 2
- a fast splice junction mapper for RNA-Seq reads.
| Version | Compilateur | Interconnexion | chemin d'accès | OS |
|---|---|---|---|---|
| 2.1.1 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/TopHat/2.1.1/x86_64 | generic |
| modulefile : TopHat/2.1.1 | ||||
| 2.0.13 | N/A | N/A | /applis/PSMN/generic/TopHat/2.0.13/x86_64 | generic |
| modulefile : TopHat/2.0.13 | ||||
La dépendance sur Bowtie (2.2.4 ou 2.2.9) est incluse dans les modulefiles.
Pour utiliser les modules, consulter Environment Modules