Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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documentation:tools:software:trimmomatic [2018/04/20 09:10] – [Trimmomatic] cpetit | documentation:tools:software:trimmomatic [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1 | ||
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Ligne 4: | Ligne 4: | ||
^ Version | ^ Version | ||
- | | 0.36 | N/A | N/A | /usr/bin | + | | 0.36 | N/A | N/A | /usr/share/ |
| | **modulefile** : aucun |||| | | | **modulefile** : aucun |||| | ||
- | |||
<code bash> | <code bash> | ||
- | module load Trimmomatic/0.36 | + | # usage type |
+ | TRIMMOMATIC=/usr/ | ||
java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | java -jar $TRIMMOMATIC PE/SE -options -de -trimm -o -matic | ||
</ | </ | ||
+ | |||
+ | <code bash> | ||
+ | ## Example | ||
+ | ## Quick start | ||
+ | # Paired End | ||
+ | java -jar <path to trimmomatic.jar> | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | |||